针对您提出的“合作挂靠公司干工程甲方未付款怎么办”的问题，这是一个涉及工程款纠纷的复杂情况，需要您按照一定的步骤来维护自己的权益。以下是我为您整理的详细解答：

一、收集证据

首先，您需要收集所有与挂靠公司和工程相关的证据，这是后续维权的基础。具体包括：

1. 挂靠协议：证明您与挂靠公司之间的挂靠关系。
2. 工程合同：明确工程的具体内容、金额、付款方式等关键条款。
3. 施工记录：记录工程的施工过程、进度等，以证明您已按合同要求完成工程。
4. 验收报告：证明工程已通过验收，符合合同要求。
5. 往来函件：包括您与挂靠公司、甲方之间的沟通记录，特别是关于工程款支付的讨论。

二、与挂靠公司协商

在收集完证据后，您可以尝试与挂靠公司进行协商。建议使用书面函件的形式，清晰表达您的支付要求及依据，包括工程款的具体金额、支付时间等。如果挂靠公司同意支付，最好签订一份书面协议，明确支付时间和方式。

三、向行政主管部门投诉

如果协商无果，您可以向相关行政主管部门投诉，如建设行政主管部门或工程所在地的政府相关部门。这些部门有权对工程款纠纷进行调解，并可能促使挂靠公司支付工程款。

四、向法院起诉

如果前两种方法都无法解决问题，您需要向有管辖权的法院提起诉讼。在起诉时，您需要提交上述收集的证据，并明确要求挂靠公司支付工程款及逾期利息。法院会依据证据和法律规定进行审理，并作出判决。

五、申请强制执行

如果挂靠公司不履行法院的判决，您可以向法院申请强制执行其财产。法院有权查封、扣押、拍卖挂靠公司的财产，以强制其履行支付工程款的义务。

额外建议：

1. 保持冷静和理性：在处理工程款纠纷时，保持冷静和理性至关重要。避免采取过激行为，以免影响自己的权益。
2. 寻求专业法律帮助：如果您对法律程序不熟悉，建议寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，提高您的维权效率。
3. 关注行业动态和政策变化：工程款纠纷的处理可能受到行业动态和政策变化的影响。因此，建议您关注相关行业的最新动态和政策变化，以便及时调整自己的维权策略。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。