结论：工资没发到手却被申报了个税，这种做法一般是不合法的。

分析：

1. 从个税申报的法律规定来看：

   • 根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》以及《国家税务总局关于发布〈个人所得税扣缴申报管理办法(试行)〉的公告》的相关规定，工资薪金所得应以实际发放工资时取得的收入为基础计算应纳税所得额。扣缴义务人（通常是雇主）应当按照实际发放的工资薪金进行税款的计算，并在规定的申报期内进行税款申报。
   • 这意味着，如果公司未实际发放工资，却申报了个税，这违反了税法规定，因为个税的申报应基于实际发放的工资。

2. 从实际操作和税务合规的角度来看：

   • 税务部门要求扣缴义务人如实申报纳税，这包括准确报告纳税人的实际收入情况。如果公司未发工资却申报了个税，这可能导致税务记录的不准确，进而影响纳税人的税务合规和信用记录。
   • 此外，如果公司长期这样做，还可能面临税务部门的调查和处罚，包括罚款、滞纳金等。

3. 从员工权益保护的角度来看：

   • 员工有权获得其应得的工资，并且有权要求公司按照实际发放的工资进行个税申报。如果公司未发工资却申报了个税，员工可以提出异议，并要求公司纠正这一错误做法。
   • 如果公司拒绝纠正，员工可以向税务部门举报，或者通过法律途径维护自己的权益。

建议：

• 如果你发现公司未发工资却申报了个税，首先应与公司沟通，要求其纠正这一错误做法。
• 如果公司拒绝纠正，你可以向当地税务部门举报，并提供相关证据（如工资条、银行流水等）以支持你的主张。
• 同时，你也可以考虑咨询专业律师（比如我，韦海团律师，专注于工伤赔偿、刑事辩护、离婚领域），以了解你的法律权益和可能的维权途径。

可能后果：

• 如果公司被查实存在未发工资却申报个税的行为，可能会面临税务部门的处罚，包括罚款、滞纳金等。
• 此外，这种行为还可能影响公司的声誉和信用记录，进而对其业务运营产生负面影响。

总之，工资没发到手却被申报了个税是不合法的。如果你遇到这种情况，应积极采取措施维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。