自行拆除顶层是否违法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、合法拆除的情形
取得合法审批手续：
- 若自行拆除顶层的行为符合相关法律法规及建设规划要求，比如取得了合法的审批手续，包括规划许可证、施工许可证等，且改造行为未损害公共利益和他人合法权益，那么通常不违法。
- 在此情况下，拆除行为被视为合法的建筑改造活动，受法律保护。
遵循安全规范：
- 拆除过程中，必须遵循相关的安全规范，确保拆除行为不会对房屋整体结构安全造成影响，也不会对周边环境及其他相邻建筑物产生不利影响。
- 若能确保安全，且拆除行为符合规划要求，则自行拆除顶层是合法的。
二、违法拆除的情形
未经合法审批：
- 如果未经合法审批，擅自拆除顶层，可能违反城乡规划法等相关规定。
- 这种私自拆除行为可能影响房屋整体结构安全，破坏原有的规划布局，还可能对周边环境及其他相邻建筑物产生不利影响，存在诸多安全隐患，因此属于违法行为。
损害公共利益或他人合法权益：
- 即使取得了部分审批手续，但如果拆除行为损害了公共利益或他人合法权益，如影响了相邻建筑物的采光、通风等，也可能被视为违法。
- 在此情况下，拆除行为可能面临法律制裁，包括责令停止违法行为、恢复原状、罚款等。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 违法拆除顶层可能面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
- 若拆除行为导致严重后果，如房屋倒塌、人员伤亡等，还可能承担刑事责任。
建议：
- 在进行任何建筑改造活动前，务必咨询当地规划部门或相关法律机构，了解相关法律法规及审批流程。
- 确保拆除行为符合规划要求，且不会损害公共利益和他人合法权益。
- 若对拆除行为是否合法存在疑问，建议暂停拆除活动，并寻求专业法律意见。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。