针对您提出的“房子盖在水库边好好几年，突然被告知非法侵占”的问题，我首先明确结论：您可能面临因非法侵占土地而需承担法律责任的风险，但具体责任和后果需根据实际情况详细分析。
一、法律背景与责任分析
土地使用权与规划：
- 根据我国相关法律法规，土地的使用必须遵循规划，并取得相应的土地使用权证。若您的房屋建设未取得合法的土地使用权，或建设位置违反了水库保护区的相关规定，则可能构成非法侵占。
- 水库周边通常设有保护区，用于保护水源安全和水库功能。在保护区内建设房屋，若未经批准，即属于违法行为。
非法侵占的法律后果：
- 若被认定为非法侵占，您可能面临责令拆除违法建筑、恢复土地原状、罚款等行政处罚。
- 在某些情况下，若非法侵占行为严重，还可能涉及刑事责任，如非法占用农用地罪等。
二、可能的情况与应对建议
情况一：未取得土地使用权证：
- 应对建议：立即停止使用该土地，并咨询当地国土资源部门或律师，了解如何合法取得土地使用权或进行土地置换。
- 法律后果：若继续非法使用，可能面临更严厉的处罚。
情况二：建设位置违反水库保护区规定：
- 应对建议：检查房屋建设位置是否确实位于水库保护区内。若是，应考虑与相关部门协商，看是否可以调整建设位置或进行其他合法补救措施。
- 法律后果：若不进行调整，可能面临拆除等处罚。
情况三：历史遗留问题：
- 应对建议：若房屋建设时间较早，且当时相关法规不完善或未严格执行，可以尝试向相关部门说明情况，寻求合法化途径或补偿方案。
- 法律后果：虽然历史遗留问题可能得到一定程度的宽容处理，但仍需遵守现行法律法规。
三、后续行动建议
收集证据：
- 收集与房屋建设相关的所有文件、合同、审批手续等，以证明您的建设行为是否合法。
- 若可能，收集周边类似情况的案例，以了解类似问题的处理方式。
咨询专业律师：
- 鉴于此类问题的复杂性，我建议您直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和应对策略。
- 律师可以帮助您分析法律风险，制定应对方案，并在必要时代表您与相关部门进行沟通。
积极配合调查：
- 若相关部门已介入调查，应积极配合，提供所需材料和信息。
- 避免逃避或抗拒调查，以免加重法律责任。
最后，我强调，面对此类问题，及时咨询和积极应对是关键。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。