结论：入职未签合同且借支款项后自行离职是否合法，需分情况讨论，主要取决于借支款项的性质、离职原因及是否履行了相应的通知或协商义务。

一、关于未签合同的问题

1. 未签合同的影响：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，且应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。若未签订书面劳动合同，用人单位可能面临支付双倍工资等法律责任。但这并不直接决定劳动者离职的合法性。

2. 未签合同下离职的合法性：

   • 无论是否签订书面劳动合同，劳动者都有权依法解除劳动关系。但关键在于解除的方式和程序是否合法。

二、关于借支款项的问题

1. 借支款项的性质：

   • 借支款项可能被视为预支工资、借款或其他性质的款项。若为预支工资，则通常与劳动关系紧密相关；若为借款，则可能涉及民间借贷法律关系。

2. 借支款项对离职合法性的影响：

   • 若借支款项为预支工资，且劳动者未按照约定或公司规定履行工作义务即离职，可能构成违约，用人单位有权要求劳动者返还预支款项或承担相应责任。但这并不直接决定离职行为本身的合法性，而是涉及违约责任的承担。
   • 若借支款项为借款，且与劳动关系无关，则劳动者离职的合法性不受借款影响。但劳动者仍需按照借款合同的约定履行还款义务。

三、关于自行离职的合法性

1. 合法离职的情形：

   • 劳动者可以依据《劳动合同法》的规定，提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同（试用期提前三日）。在此情况下，劳动者自行离职是合法的。
   • 若用人单位存在未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等违法行为，劳动者可以立即解除劳动合同，无需提前通知。

2. 非法离职的情形：

   • 若劳动者未按照上述规定履行通知义务或协商义务即擅自离职，可能构成违法解除劳动合同，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。

四、综合分析与建议

1. 若借支款项为预支工资：

   • 建议您先与用人单位协商解决借支款项的返还问题，并按照规定履行离职手续。若协商无果，可依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

2. 若借支款项为借款：

   • 借款行为与劳动关系无关，您应按照借款合同的约定履行还款义务。同时，若您希望离职，应依法履行离职手续，避免因非法离职而承担赔偿责任。

3. 无论何种情况：

   • 我都建议您在离职前与用人单位进行充分沟通，明确双方的权利和义务，避免因信息不对称或沟通不畅而引发不必要的法律纠纷。

如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律服务。