针对您提出的“行政处罚同一主体不同事由的罚款算重复处罚吗”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们需要明确“一事不再两罚”的原则。这一原则的核心在于防止行政机关对同一违法行为进行重复处罚，从而保护当事人的合法权益。具体来说，“一事”指的是同一个违法行为或事实，“不再两罚”则意味着对同一违法行为不能给予两次或两次以上的同一种类处罚，特别是罚款。

接下来，我们针对您的问题进行具体分析。您提到的是“同一主体不同事由”的罚款。这里的关键在于“不同事由”。如果这些事由分别构成了不同的违法行为，且每个违法行为都独立满足了行政处罚的条件，那么行政机关是可以分别对这些违法行为进行处罚的，包括罚款。因为这种情况下，每个处罚都是针对一个独立的违法行为，而不是对同一个违法行为的重复处罚。

然而，如果行政机关试图将同一主体的多个行为或事实，即使它们涉及不同的事由，但本质上构成同一个违法行为的不同方面或阶段，进行拆分并分别处罚，那么这就可能违反了“一事不再两罚”的原则。例如，如果某个主体的一个连续行为违反了多个法律规范，但本质上是一个整体行为，那么行政机关就不能对这个整体行为进行多次罚款。

此外，我们还需要注意《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定。该法明确规定，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。如果同一个违法行为违反多个法律规范应当给予罚款处罚的，应按照罚款数额高的规定处罚。

综上所述，对于“行政处罚同一主体不同事由的罚款是否算重复处罚”的问题，关键在于判断这些事由是否分别构成了不同的违法行为。如果它们分别构成了不同的违法行为，且每个违法行为都独立满足了行政处罚的条件，那么行政机关是可以分别进行处罚的。但如果它们本质上构成同一个违法行为的不同方面或阶段，那么行政机关就不能进行重复处罚。

因此，在实际操作中，行政机关应准确认定违法行为的事实和性质，避免将同一违法行为拆分为多个行为进行处罚，以确保执法的公正性和合理性。