关于加班调休如何与员工协商的问题，这是一个涉及员工权益保护和公司管理规范的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，公司安排加班必须与员工协商。根据我国《中华人民共和国劳动法》的相关规定，公司因生产经营需要安排员工加班时，必须事先与工会和劳动者进行协商，并在员工自愿的基础上安排加班。这一原则体现了对员工休息权益的尊重和保护，确保了员工在工作与生活之间的平衡。因此，在协商加班调休时，公司应充分尊重员工的意愿，不得强制要求员工加班或调休。

其次，加班时间需严格遵守限制。在协商一致的基础上，公司安排加班还需严格遵守时间限制。一般来说，每日加班不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，也需在保障员工身体健康的条件下进行，且每日加班时间不得超过三小时，每月累计加班时间不得超过三十六小时。这些规定旨在防止过度加班对员工身心健康造成不良影响。因此，在协商加班调休时，公司应明确告知员工加班的具体时间和调休的安排，确保符合法律法规的要求。

接下来，特殊情况下的加班安排需依法处理。尽管原则上公司需与员工协商加班事宜，但在某些特殊情况下，如发生自然灾害、事故等紧急事件，威胁员工生命健康和财产安全，需要紧急处理时，公司可依法无需协商直接安排加班。然而，在这种情况下，公司也应尽快与员工沟通，说明加班的紧急性和必要性，并在事后给予合理的调休或补偿。

此外，员工权益保护至关重要。如果公司未与员工协商一致就强制要求加班或调休，或者违反法律规定超时加班，员工有权拒绝，并可以通过多种合法途径来维护自己的权益。例如，员工可以与公司进行沟通协商，寻求合理解决方案；也可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并制止违法行为；还可以申请劳动仲裁或提起诉讼，通过法律手段维护自己的合法权益。

最后，特殊群体的加班保护需特别关注。对于怀孕7个月以上的女职工和哺乳未满1周岁婴儿的女职工等特殊群体，公司在安排加班或调休时需特别注意法律法规的禁止性规定。根据《女职工劳动保护特别规定》，这些女职工在特定时期内不得被安排延长工作时间或夜班劳动。公司应严格遵守相关规定，确保特殊群体的合法权益得到充分保护。

综上所述，关于加班调休如何与员工协商的问题，公司应遵循法律规定，与员工进行充分协商，并确保员工的合法权益得到全面保障。在协商过程中，公司应尊重员工的意愿，明确加班时间和调休安排，关注员工的身心健康和合法权益，特别是对于特殊群体要给予特别的保护和关爱。