针对您提出的“员工手册不合法签字是否有效”的问题，这实际上涉及到了员工手册的合法性、签字行为的法律效力以及两者之间的关系。以下是我为您提供的详细解答：
一、员工手册的合法性基础
员工手册作为企业用工管理的重要文件，其合法性主要来源于两个方面：一是内容合法，即手册中的各项规定不得违反国家法律法规的强制性规定；二是程序合法，即手册的制定、修改和废止应当遵循民主程序，如经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定等。
二、签字行为的法律效力
签字行为本身是一种法律行为，表示签字人对文件内容的认可和接受。在员工手册的情境下，员工签字通常意味着员工已经阅读并理解了手册的内容，并同意遵守其中的规定。然而，签字行为的法律效力并非绝对，它受到文件内容合法性和程序合法性的制约。
三、员工手册不合法时签字的有效性
内容不合法：如果员工手册中的某些规定违反了国家法律法规的强制性规定，那么这些规定本身就是无效的。即使员工签了字，也不能改变这些规定的非法性质。在这种情况下，员工有权拒绝遵守这些非法规定，并可以依法维护自己的合法权益。
程序不合法：如果员工手册的制定、修改或废止没有遵循民主程序，如未经职工代表大会或全体职工讨论，未与工会或职工代表平等协商确定等，那么手册的合法性可能会受到质疑。在这种情况下，即使员工签了字，也不能完全证明手册的合法性和有效性。因为程序上的瑕疵可能导致手册在法律上被认定为无效或部分无效。
四、建议与措施
企业应确保员工手册的合法性和程序性：企业应定期审查员工手册的内容，确保其符合国家法律法规的强制性规定；同时，应遵循民主程序制定、修改和废止员工手册，确保程序的合法性和公正性。
员工应仔细阅读并理解员工手册的内容：在签字前，员工应仔细阅读员工手册的内容，确保自己理解并同意其中的各项规定。如果发现手册中有违法或不合理的内容，应及时向企业提出异议。
依法维护自己的合法权益：如果员工发现员工手册存在违法或不合理的内容，并且企业拒绝修改或废止这些内容，员工可以依法向劳动争议调解机构或劳动争议仲裁委员会申请调解或仲裁，维护自己的合法权益。
综上所述，员工手册不合法时签字的有效性取决于手册内容的合法性和程序的合法性。如果手册内容或程序存在违法或不合理的情况，那么签字行为可能无法完全证明手册的合法性和有效性。因此，企业和员工都应重视员工手册的合法性和程序性，确保用工管理的合法性和公正性。