针对您提出的“公司账户被冻结员工工资怎么办，以及能不能以发工资为由申请解封账户”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、公司账户被冻结后员工工资的处理办法
了解并解决账户冻结问题：
- 公司应首先查明账户冻结的具体原因，如经济纠纷、诉讼保全或严重违法违规行为等。
- 根据冻结原因，公司应积极采取措施解决纠纷，例如与债权人协商、履行法院判决或纠正违法行为，以便尽快解冻账户。
与员工沟通协商：
- 公司有义务及时向员工说明账户冻结情况及预计的解决时间，以避免员工恐慌和误解。
- 双方可协商临时解决方案，如延期支付工资、部分支付工资或采用替代支付方式等。
采取替代支付方式：
- 现金支付：从公司备用金中支取现金发放工资，但需确保现金安全，并让员工签字确认领取。
- 个人银行账户支付：公司负责人或授权人员可使用个人银行账户代公司支付工资，并明确备注款项用途。但需注意，这种方式可能涉及税务和合规性问题，需谨慎操作。
- 委托代发：可与其他具备代发工资资质的金融机构或第三方支付平台协商，委托其代发工资。在此过程中要明确双方的权利义务关系，保障工资发放的安全与准确。
- 更换支付账户：在符合相关规定的前提下，公司可以重新开设新的银行账户，用于工资发放。但要确保新账户的合法性和合规性，并及时通知员工相关变更信息。
二、能否以发工资为由申请解封账户
- 一般情况：公司账户被冻结通常是由于涉及法律纠纷、税务问题或违规行为等。解封账户需要解决导致冻结的根本问题，而不仅仅是出于发工资的目的。
- 特殊情况协商：虽然直接以发工资为由申请解封账户可能不太现实，但公司可以尝试与冻结机关（如法院、税务机关等）沟通，说明账户冻结对员工工资发放的影响，并探讨是否有临时解封或部分解封的可能性，以便及时发放工资。然而，这通常需要公司提供相应的担保或解决方案，并经过冻结机关的严格审查。
- 法律途径：如果公司认为账户冻结不当或存在其他合法理由需要解封，可以通过法律途径提出异议或申请复议。但这需要专业的法律支持和证据支持。
三、建议与总结
- 积极应对：公司应积极应对账户冻结问题，尽快查明原因并采取措施解决纠纷。
- 保障员工权益：在账户冻结期间，公司应确保员工工资的按时发放，可以通过与员工协商、采取替代支付方式等措施来实现。
- 法律合规：公司在处理账户冻结和工资发放问题时，应确保所有操作都符合法律法规的要求，避免引发新的法律纠纷。
综上所述，虽然直接以发工资为由申请解封账户可能不太现实，但公司可以通过与冻结机关沟通、采取替代支付方式等措施来确保员工工资的按时发放。同时，公司也应积极解决导致账户冻结的根本问题，以恢复账户的正常使用。