企业违法解除的赔偿金，在支付时并不必然需要先按法院判决书全额支付后再考虑个税问题，实际上，违法解雇的经济赔偿金一般不需要缴纳个人所得税。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、违法解雇赔偿金的性质
根据相关法律法规及税务实践，用人单位因违法解除劳动关系向劳动者支付的经济赔偿金，具有惩罚性质。这与经济补偿金的定义和性质存在明显区别。经济补偿金通常是在合法解除劳动关系时，用人单位根据劳动者的工作年限和工资水平给予的一次性补偿，而经济赔偿金则是对用人单位违法行为的惩罚。
二、税务处理规定
一般规定：
- 依据《关于个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入征免个人所得税问题的通知》以及《关于个人因解除劳动合同取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》的规定，个人领取一次性补偿收入时，在特定情况下（如超过当地上年职工平均工资3倍数额的部分）应缴纳个人所得税。但这些规定主要针对的是经济补偿金，而非具有惩罚性质的经济赔偿金。
违法解雇赔偿金的税务处理：
- 由于违法解雇的经济赔偿金不属于上述规定中应当缴纳个人所得税的范畴，因此，在一般情况下，用人单位支付给劳动者的违法解雇赔偿金不需要代扣代缴个人所得税。
三、实际操作建议
确认赔偿金性质：
- 在支付赔偿金前，用人单位和劳动者应明确赔偿金的性质，确保其属于违法解雇的经济赔偿金，而非其他类型的补偿或赔偿。
税务咨询与核实：
- 若对赔偿金的税务处理存在疑问，建议携带相关资料至税务机关进行核实确认。税务机关会根据具体情况提供准确的税务指导。
遵守法院判决：
- 如果法院已经就违法解雇赔偿金作出判决，用人单位应严格遵守判决内容，按时足额支付赔偿金。在支付过程中，无需额外代扣代缴个人所得税，除非税务机关另有明确指示。
四、特殊情况考虑
- 虽然违法解雇的经济赔偿金一般不需要缴纳个人所得税，但也不能排除在特定情况下税务机关可能要求代扣代缴的可能性。例如，如果赔偿金中包含了其他应税收入（如奖金、津贴等），或者税务机关认为赔偿金数额过高需要调整等。因此，在实际操作中，建议用人单位和劳动者保持与税务机关的沟通，确保税务处理的合规性。
总结与建议：企业违法解除的赔偿金在支付时一般不需要代扣个人所得税。但为了确保税务处理的合规性，建议用人单位和劳动者在支付前咨询税务机关或专业税务人士的意见。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律建议。