女方要求重新写协议车（这里假设是指与车辆相关的协议，如车辆归属、使用或处分协议等）在合法且双方自愿的基础上是合法的。以下从不同角度进行分析：

1. 协议变更的合法性基础

• 自愿原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动应当遵循自愿原则。这意味着，如果女方和男方都同意重新签订与车辆相关的协议，并且这种变更不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这种变更是合法的。
• 合同变更：如果原有的车辆协议是双方真实意思表示且合法的合同，那么根据合同法的相关规定，双方可以通过协商一致的方式变更合同内容。这种变更同样需要遵循自愿、公平、诚实信用的原则。

2. 可能涉及的合法性问题

• 协议内容合法性：重新签订的协议内容必须合法，不能包含违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗的条款。例如，协议不能规定非法占有或处分他人车辆的内容。
• 程序合法性：协议的变更应当遵循一定的程序，如双方应当就变更内容达成一致，并可能需要以书面形式确认变更。如果涉及车辆过户等手续，还需要按照相关规定办理。

3. 实际操作中的建议

• 明确变更内容：在重新签订协议前，双方应当明确变更的具体内容，包括车辆的归属、使用、处分等权利义务的变更。
• 书面确认：为了保障双方的权益，建议将变更内容以书面形式确认，并由双方签字或盖章。
• 办理相关手续：如果协议变更涉及车辆过户等手续，双方应当按照相关规定及时办理，以确保变更的合法性和有效性。

4. 可能存在的风险及防范

• 一方反悔：在协议变更过程中，可能存在一方反悔的情况。为了避免这种情况的发生，双方可以在协议中约定违约责任或赔偿条款。
• 协议无效：如果协议变更内容违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗，可能导致协议无效。因此，在签订协议前，双方应当仔细审查协议内容，确保其合法性。

总结与建议：

女方要求重新写与车辆相关的协议在合法且双方自愿的基础上是合法的。为了确保协议的合法性和有效性，双方应当明确变更内容、以书面形式确认变更、并按照相关规定办理相关手续。同时，双方也应当注意防范可能存在的风险，如一方反悔或协议无效等情况。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。