第三次起诉离婚，法院不一定会判决离婚。法院在判决是否准予离婚时，并非依据起诉次数，而是依据夫妻感情是否确已破裂以及调解是否有效。以下从不同角度为您详细分析：

法院判决离婚的标准

根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。因此，无论是第几次起诉，法院都会首先进行调解，并审查夫妻感情是否确已破裂。

起诉方需提供充足证据

起诉方需要提供充足的证据来证明夫妻感情确已破裂。这些证据可能包括但不限于：

1. 重婚或与他人同居：如果被告存在重婚或与他人同居的行为，这将是证明夫妻感情破裂的有力证据。
2. 实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员：家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的行为，同样能够证明夫妻感情已经破裂。
3. 有赌博、吸毒等恶习屡教不改：如果被告有赌博、吸毒等恶习，且屡教不改，这也会影响夫妻感情，成为判决离婚的依据。
4. 因感情不和分居满二年：如果双方因感情不和已经分居满二年，这将是证明夫妻感情破裂的重要证据。需要注意的是，单纯的分居并不足以证明感情破裂，必须是因为感情不和而分居。
5. 其他导致夫妻感情破裂的情形：除了上述情形外，如果存在其他导致夫妻感情破裂的情形，如一方患有严重疾病无法治愈、一方有严重精神障碍等，也可以作为判决离婚的依据。

分居情况的具体分析

在您提到的情况中，被告与原告已经分居。然而，单纯的分居并不足以直接导致法院判决离婚。关键在于分居的原因是否是因为感情不和，以及分居的时间是否已经达到法定标准（即因感情不和分居满二年）。如果分居是因为工作、学习等原因，且时间未达到二年，那么这可能不足以证明夫妻感情已经破裂。

实际操作中的建议

1. 收集证据：在第三次起诉离婚前，原告应尽可能收集能够证明夫妻感情确已破裂的证据。这些证据可以包括书面材料、照片、视频、证人证言等。
2. 准备充分：除了感情破裂的证据外，原告还需要准备好其他相关材料，如双方身份信息、结婚证明、子女出生证明（如有）、财产清单等。这些材料将有助于法院更好地了解案情，并作出公正的判决。
3. 寻求专业帮助：由于离婚案件涉及法律程序和证据收集等方面的问题，建议原告在起诉前寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助原告更好地维护自己的合法权益。