可以起诉。针对您提出的公司未履行持股会章程规定的员工退休公司回购股权的规定，且违约已达13年的情况，以下是从不同角度的详细分析：

一、法律背景与依据

1. 合同关系：持股会章程作为公司内部的管理规定，一旦被员工接受并成为持股会成员，即构成了一种合同关系。公司有义务按照章程规定履行回购股权的义务。

2. 违约责任：当公司未按照章程规定履行回购义务时，即构成违约。员工有权要求公司承担违约责任，包括但不限于要求公司履行回购义务、赔偿因违约造成的损失等。

二、可能的法律后果与建议

1. 要求公司履行回购义务：

   • 您可以向公司发出书面通知，要求其按照持股会章程的规定履行回购股权的义务。
   • 如果公司拒绝履行，您可以考虑通过法律途径解决，即向法院提起诉讼，要求公司履行回购义务。

2. 要求公司赔偿损失：

   • 由于公司违约长达13年，您可能因此遭受了经济损失，如股权价值的贬值、无法及时获得回购款项导致的资金占用损失等。
   • 在诉讼中，您可以要求公司赔偿这些损失。赔偿金额的计算可以根据实际损失情况，结合相关证据进行确定。

3. 诉讼时效问题：

   • 虽然违约时间长达13年，但并不意味着您已经丧失了诉讼权利。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 如果您在此期间内一直向公司主张权利，或者公司一直承认其违约行为，那么诉讼时效可能会中断并重新计算。因此，具体是否超过诉讼时效，还需要根据您的实际情况和证据来判断。
   • 即便超过诉讼时效，您仍然可以起诉，只是公司可能提出诉讼时效抗辩，若法院认定超过诉讼时效，您可能丧失胜诉权，但起诉行为本身不受影响。

4. 证据收集与准备：

   • 在提起诉讼前，您需要收集并整理相关证据，如持股会章程、公司未履行回购义务的证据、您因此遭受的损失证据等。
   • 这些证据将有助于支持您的诉讼请求，并增加胜诉的可能性。

三、实际操作建议

1. 咨询专业律师：虽然我作为陈晓辉律师可以为您提供法律咨询，但在实际操作中，建议您还是咨询一位熟悉公司法务和股权转让领域的专业律师，以便更准确地评估您的案件情况和制定诉讼策略。不过，您现在就可以直接向我咨询相关问题，我会尽我所能为您提供帮助。

2. 保持沟通与协商：在提起诉讼前，您可以尝试与公司进行沟通与协商，看是否能够达成和解协议。这有助于节省诉讼成本和时间，并维护双方的关系。

3. 注意诉讼风险：任何诉讼都存在风险，包括可能败诉、诉讼成本高昂等。因此，在决定提起诉讼前，您需要充分评估诉讼风险，并做好相应的准备。

针对您的情况，我建议您首先收集相关证据，并咨询专业律师以评估案件情况和制定诉讼策略。如果决定提起诉讼，务必注意诉讼时效问题，并做好充分的准备。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。