父亲出钱买的厂房登记在儿子名下，法院在某些情况下是可以查封的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法院查封的法律依据与情形
债务纠纷：如果儿子存在债务纠纷，且债权人认为儿子名下的厂房可能与债务相关，为了保障债权的实现，债权人可以向法院申请查封该厂房。法院在审查相关证据后，如果认为厂房确实与债务有关，且符合查封的法定条件，就有可能对该厂房进行查封。
违法犯罪行为：若儿子因违法犯罪行为导致需要被追究责任，且该厂房与案件相关，如作为犯罪工具或违法所得等，那么法院在执行相关法律程序时，也有权利对该厂房进行查封。
二、父亲权益的保护与证据提供
出资证明：父亲如果能够证明其出资行为，并有明确的证据，如转账记录、出资协议等，表明厂房实际上是其出资购买，只是登记在儿子名下，那么法院在查封时会考虑到父亲的权益。在这种情况下，父亲可以通过合法的途径向法院主张自己的权益，以避免厂房被不合理地查封。
赠与协议：如果父亲将厂房登记在儿子名下是出于赠与等合法的行为，并且已经完成了相关的法律手续，如签订了赠与协议并进行了公证等，那么在一般情况下，法院是不能随意查封该厂房的。因为此时厂房已经属于儿子的合法财产，受到法律的保护。但是，如果存在恶意逃避债务等情形，法院仍可能突破这种登记的表象，对厂房进行查封。
三、具体案例与法院审查判断
在实际案例中，法院会根据案件的具体情况、相关法律规定以及法院的审查判断来确定是否查封厂房。例如，如果父亲能够提供充分的证据证明其出资事实，并且表明自己对厂房拥有权益，那么法院在查封时会更加谨慎。相反，如果父亲无法提供充分的证据，或者厂房确实与儿子的债务或违法犯罪行为有关，那么法院查封的可能性就会增加。
建议：
在处理此类问题时，务必依据相关法律法规和案件事实进行综合判断。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。