建筑公司内部高管垫资做项目，其合法性并非绝对，而是取决于具体情况和相关约定。以下从不同角度进行详细分析：

一、垫资行为的合法性基础

在建筑市场中，垫资行为并不罕见。若建筑公司内部高管与建筑公司（或项目发包方）之间就垫资事宜达成了明确且合法的约定，包括垫资金额、垫资期限、利息计算方式等，那么这种垫资行为在法律上是受到保护的。高管有权根据约定条款，要求建筑公司或项目发包方归还垫资款项及其对应利息。但需注意，如果约定的利息计算标准超出法律规定的范畴（如超出中国人民银行公布的同期同类贷款利率的四倍），则超出部分的利息请求将不被法律认可。

二、无明确约定时的处理

若双方关于垫资事宜未曾进行过明确约定，那么垫资行为可能被视为工程欠款问题来对待解决。在这种情况下，高管作为垫资方，其权益保护将依赖于工程欠款的相关法律规定。如果高管试图主张垫资利息，但无根无据，那么其请求将不会得到法律的支持。

三、政府投资项目的特殊限制

对于政府投资项目，相关部门可能出台了规范性文件，对施工单位（包括建筑公司内部高管代表的施工单位）垫资承包进行了限制。这类项目通常禁止施工单位带资承包，以防止出现财政风险和拖欠工程款等不良后果。因此，在政府投资项目中，建筑公司内部高管应特别注意遵守相关规定，避免违规垫资行为带来的法律风险。

四、垫资行为的合法性判断因素

在具体操作中，建筑公司内部高管垫资做项目的合法性还需根据以下因素进行综合判断：

1. 双方约定：是否有明确且合法的约定，包括垫资金额、期限、利息等。这是判断垫资行为合法性的首要条件。
2. 垫资目的：垫资行为是否出于工程顺利进行的需要。如果高管为了工程的顺利进行而暂时垫付资金，并且后续能够从建筑公司或项目发包方处获得相应的款项，这样的垫资行为通常是合理的。
3. 法律法规：垫资行为是否违反相关法律法规的强制性规定。高管需确保垫资行为不违反国家法律法规，否则将可能面临法律制裁。

五、法律建议与风险提示

1. 明确约定：无论垫资施工在当前社会环境下是否无法完全避免，各方都应该在相应的合同文件中对此作出明确的约定，同时确定是否需要支付利息以及具体的利息计算方式。
2. 寻求担保：对于那些不可避免需要垫资施工的项目，有关方面可以通过寻求业主的协助，要求业主寻找第三方机构或个人提供充分且适当的担保，如银行保函或其他形式的抵押品，来尽可能降低可能出现的风险。
3. 遵守规定：在政府投资项目中，应特别注意遵守相关规定，避免违规垫资行为带来的法律风险。

建筑公司内部高管垫资做项目并非绝对合法或非法，而是需要根据具体情况和相关约定进行综合判断。在实际操作中，建议高管在垫资前充分了解相关法律法规，与建筑公司或项目发包方进行明确约定，并寻求必要的担保措施，以确保自身权益得到妥善保护并避免潜在的法律风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。