公司若未明确告知哪些文件属于保密文件，在追责时确实会面临一定的法律挑战，但并不意味着无法追责。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、保密义务的法律基础

1. 合同约定：如果公司与员工之间签订了保密协议，并且协议中明确规定了保密文件的范围、保密义务及违约责任，那么公司可以依据合同条款进行追责。即使公司未明确告知哪些文件是保密的，但只要员工能够合理推断出某些文件属于保密范畴（如基于文件内容、性质或公司惯例），且违反了保密义务，公司就有权追究其责任。

2. 法律规定：根据《中华人民共和国反不正当竞争法》等相关法律法规，经营者不得违反保密义务或者违反权利人有关保守商业秘密的要求，披露、使用或者允许他人使用其所掌握的商业秘密。这里的“商业秘密”包括技术信息和经营信息，且这些信息应当具有秘密性、价值性和保密性。如果公司文件符合商业秘密的构成要件，即使未明确告知为保密文件，员工泄露也可能构成违法。

二、未明确告知的法律后果及追责可能性

1. 举证责任：在追责过程中，公司需要承担举证责任，证明员工确实泄露了保密信息，并且该信息属于公司保密范畴。如果公司未明确告知哪些文件是保密的，这可能会增加举证的难度。但公司可以通过其他证据（如文件内容、性质、公司惯例、员工职责等）来间接证明文件的保密性。

2. 追责途径：

   • 内部处理：公司可以根据内部规章制度对泄露保密信息的员工进行纪律处分，如警告、罚款、解雇等。
   • 民事诉讼：如果泄露行为给公司造成了经济损失，公司可以向法院提起民事诉讼，要求员工赔偿损失。
   • 刑事诉讼：在极端情况下，如果泄露行为构成犯罪（如侵犯商业秘密罪），公司可以向公安机关报案，追究员工的刑事责任。

三、建议与措施

1. 完善保密制度：公司应制定完善的保密制度，明确保密文件的范围、保密义务及违约责任，并通过培训、公告等方式确保员工知晓。

2. 加强文件管理：对保密文件进行分类管理，设置访问权限，确保只有授权人员才能接触。

3. 签订保密协议：与员工签订保密协议，明确保密义务和违约责任，为追责提供法律依据。

4. 及时取证：一旦发现泄露行为，公司应及时取证，包括收集泄露的文件、聊天记录、邮件等证据，以便在追责时提供有力支持。

若公司在保密文件管理上存在疏漏，如未明确告知哪些文件是保密的，这并不妨碍公司在发现泄露行为后进行追责。但为了降低追责难度和风险，公司应完善保密制度，加强文件管理，并与员工签订保密协议。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。