结论：在交通事故后，若与对方车主签订了关于后遗症全权负责的协议，该协议在法律上具有一定的效力，但具体实施和后续处理需依据协议内容、法律规定及实际情况进行。以下从多个角度对此问题进行分析。
一、协议的法律效力
协议内容合法性：首先，该协议需确保内容合法，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。若协议中明确约定了对方车主对交通事故后遗症的全权责任，且该约定不违反上述原则，则协议在法律上通常是有效的。
双方真实意思表示：协议的签订需基于双方的真实意思表示，即双方均是在自愿、平等、公平的基础上签订的，不存在欺诈、胁迫等情形。若满足此条件，协议对双方均具有约束力。
二、协议实施中的注意事项
明确后遗症范围及责任：协议中应明确后遗症的具体范围、诊断标准及对方车主应承担的责任方式（如医疗费用、误工费、护理费等）。这有助于在后续实施中减少争议。
保留相关证据：在交通事故发生后，应及时就医并保留好所有与后遗症相关的医疗记录、费用发票等证据。这些证据在后续要求对方车主履行协议时至关重要。
协商与诉讼：若对方车主未按协议履行责任，首先应尝试通过协商解决。若协商无果，可依据协议向法院提起诉讼，要求对方车主承担相应的法律责任。
三、可能面临的法律后果
对方车主履行协议：若对方车主按协议履行了责任，则问题得到妥善解决。
对方车主不履行协议：
四、特殊情况考虑
协议存在瑕疵：若协议存在内容不明确、违反法律强制性规定等瑕疵，可能影响其法律效力。此时，需根据具体情况判断协议是否可撤销或变更，并据此采取相应的法律措施。
后遗症的鉴定与认定：在要求对方车主承担后遗症责任时，可能需要对后遗症进行鉴定和认定。这通常需要专业的医疗机构或鉴定机构出具相关报告。因此，在签订协议时，可考虑约定由双方共同认可的机构进行鉴定和认定。
建议：在签订此类协议时，务必确保协议内容明确、合法，并保留好所有相关证据。若在后续实施过程中遇到问题，可及时咨询专业律师（即我本人，封云凯律师，专注于交通事故等领域），以便更好地维护自己的合法权益。