固定总价合同仅施工了一部分，采用清单计价是否合法，需分情况讨论：
合同有明确约定：
- 如果固定总价合同中已经明确约定了，在合同履行过程中，若因各种原因（如设计变更、工程量增减等）导致仅施工了一部分，双方可以协商采用清单计价或其他计价方式来调整合同价款，那么这种做法是合法的。因为合同是双方自愿达成的协议，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，双方就有权按照合同约定来履行和调整。
合同无明确约定，但双方协商一致：
- 如果合同中没有明确约定在仅施工一部分的情况下可以采用清单计价，但双方在实际履行过程中通过协商达成了一致意见，决定采用清单计价来调整合同价款，那么这种做法也是合法的。因为民事法律行为尊重当事人的意思自治，只要双方协商一致，且不违反法律、行政法规的强制性规定，就可以按照协商的结果来履行。
合同无明确约定，且双方未协商一致：
- 如果合同中没有明确约定在仅施工一部分的情况下可以采用清单计价，且双方在实际履行过程中未能就采用清单计价达成一致意见，那么一方擅自采用清单计价来调整合同价款就是不合法的。因为这种情况下，擅自改变计价方式可能损害另一方的利益，违反了合同约定的计价原则和公平原则。此时，双方应继续按照固定总价合同的约定来履行，或者通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来解决争议。
法律背景与建议：
- 在签订固定总价合同时，双方应尽可能明确约定在合同履行过程中可能出现的各种情况及其处理方式，包括但不限于工程量增减、设计变更、计价方式调整等。这样可以在合同履行过程中减少争议和纠纷。
- 如果在合同履行过程中确实出现了仅施工一部分的情况，且合同中没有明确约定如何处理，双方应积极协商，寻求合理的解决方案。如果协商不成，可以寻求第三方调解、仲裁或提起诉讼等方式来解决争议。
- 在任何情况下，双方都应遵守法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。
可能的法律后果：
- 如果一方擅自采用清单计价来调整合同价款，且这种做法被认定为不合法，那么该方可能需要承担违约责任，包括但不限于赔偿对方因此遭受的损失、支付违约金等。
- 如果双方因计价方式调整问题发生争议并提起诉讼或仲裁，那么法院或仲裁机构将根据合同约定、法律规定以及双方的实际履行情况来作出裁决或调解。
因此，在固定总价合同仅施工了一部分的情况下，采用清单计价是否合法需根据合同约定和双方协商情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。