针对您提出的“工资条里的社保补助算加班的时候加进去了合法吗”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们需要明确工资和社保是两个不同的概念。根据《关于工资总额组成的规定》，工资总额是指各单位在一定时期内直接支付给本单位全部职工的劳动报酬总额，它包括了计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资。而社保，则是指国家建立的基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，这是用于保障公民在特定情况下（如年老、疾病、工伤、失业、生育）依法获得物质帮助的权利。

接下来，我们分析工资条里的社保补助。社保补助，如果是指公司为了弥补未给员工缴纳社保而给予的补贴，那么这种做法本身是不合法的，因为公司有义务为员工缴纳社保。但如果这里的社保补助是指公司额外给予员工的一种福利或补贴，并且明确标注在工资条上，那么这部分补助本身作为工资的一部分是合法的。然而，关键在于这部分补助是否被正确地计算在了加班工资中。

现在，我们来看加班工资的计算。加班工资是基于员工的正常工资（即不包括加班工资本身的部分）来计算的。如果公司将社保补助也纳入到了加班工资的计算基数中，那么这可能会引发问题。因为社保补助，如果它不是员工正常劳动报酬的一部分（即不是基于员工的工作时间、工作量或工作成果来计算的），那么它就不应该被纳入到加班工资的计算中。

结论：工资条里的社保补助，如果它是公司额外给予的福利或补贴，并且明确标注在工资条上，那么这部分补助本身作为工资的一部分是合法的。但是，在计算加班工资时，不应该将这部分社保补助纳入计算基数，除非它明确构成了员工正常劳动报酬的一部分。如果公司错误地将社保补助纳入了加班工资的计算中，那么这种做法可能是不合法的，因为它可能违反了关于加班工资计算的相关规定。

因此，建议您仔细审查工资条，确保加班工资的计算是基于正确的工资基数。如果您对工资条或加班工资的计算有任何疑问，建议您及时与公司的人力资源部门或财务部门进行沟通，以维护自己的合法权益。