核心结论：网签合同给出时间晚导致个人所得税无法退还，需根据具体原因采取针对性措施，包括与税务机关沟通、核查合同与纳税义务关联性、申请行政复议或提起行政诉讼等。以下是具体分析：

1. 核查网签合同与退税条件的直接关联性

根据《个人所得税法》及实施条例，退税需满足“实际发生”且“符合法定条件”的要求。若网签合同延迟导致无法证明纳税义务的实际发生时间（如购房合同未及时网签导致无法证明房屋交易时间），可能影响退税资格。
建议：

• 立即整理购房合同、付款凭证、网签备案记录等材料，证明交易实际发生时间早于纳税申报时间；
  
• 若因开发商或中介原因导致网签延迟，可要求其出具书面说明，作为补充证据提交税务机关。

2. 与税务机关沟通，明确拒绝退税的具体依据

税务机关拒绝退税需出具书面通知，并载明法律依据（如《税收征收管理法》第五十一条）。若通知未明确说明网签合同延迟与退税的因果关系，可能存在程序瑕疵。
建议：

• 书面要求税务机关提供拒绝退税的详细理由及法律依据；
  
• 若税务机关以“未及时提交网签合同”为由拒绝，可主张网签合同仅为形式要件，实际交易已通过其他证据（如付款记录、房屋交付证明）证明。

3. 申请行政复议或提起行政诉讼

若税务机关拒绝退税的理由不充分或程序违法，可通过行政复议或行政诉讼维护权益。
法律依据：

• 《行政复议法》第九条：公民可在知道税务机关具体行政行为之日起60日内申请复议；
  
• 《行政诉讼法》第四十六条：可在知道或应当知道行政行为之日起6个月内提起诉讼。
  建议：
  
• 优先申请行政复议（成本低、效率高），若复议结果不利再提起诉讼；
  
• 委托律师整理证据链，重点证明网签合同延迟与退税资格无必然联系。

4. 核查是否存在其他退税障碍

除网签合同外，退税还需满足其他条件（如纳税时间、收入性质等）。若同时存在其他问题（如未按规定申报专项附加扣除），需一并解决。
建议：

• 重新核对个人所得税申报记录，确认是否存在漏报、错报；
  
• 若因自身原因导致退税失败，可主动更正申报并补交材料。

总结：网签合同延迟可能影响退税，但并非绝对障碍。关键在于证明实际交易时间及纳税义务的合法性。建议优先与税务机关沟通，必要时通过法律途径解决。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。