大股东申请辞职而小股东不同意，这一行为本身并不直接构成违法。但具体是否违法，需结合公司章程、股东协议以及相关法律法规进行综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、公司章程与股东协议的角度

1. 公司章程规定：

   • 如果公司章程中明确规定了股东辞职或退出的程序和条件，那么大股东需按照章程规定进行操作。若大股东未遵循章程规定而擅自辞职，可能构成对公司章程的违反，但不一定直接构成违法，而是可能引发公司内部的纠纷或诉讼。

2. 股东协议约定：

   • 如果股东之间签订了股东协议，且协议中约定了股东辞职或退出的相关条款，那么大股东同样需遵守协议约定。违反协议约定可能构成违约，需承担违约责任，但同样不一定直接构成违法。

二、法律法规的角度

1. 《公司法》相关规定：

   • 根据《公司法》的规定，股东有权依法转让其股权，但并未直接规定股东可以“辞职”或“退出”公司。股东的退出通常通过股权转让、公司回购、减资等方式实现。
   • 如果大股东希望通过“辞职”的方式退出公司，实际上可能是想通过股权转让或其他方式实现。在此过程中，需遵守《公司法》关于股权转让的规定，如其他股东的优先购买权等。

2. 违法性的判断：

   • 大股东申请辞职本身并不直接违反《公司法》或其他法律法规。但如果大股东在辞职过程中存在欺诈、胁迫、恶意串通等行为，损害公司或其他股东的利益，则可能构成违法。
   • 另外，如果大股东未按照公司章程或股东协议的规定进行操作，导致公司或其他股东遭受损失，也可能需承担相应的法律责任。

三、实际操作与建议

1. 协商解决：

   • 在大股东申请辞职而小股东不同意的情况下，首先建议双方进行协商，寻求妥善解决方案。可以通过股权转让、公司回购、增资扩股等方式实现大股东的退出。

2. 遵循公司章程与股东协议：

   • 在协商过程中，双方应严格遵循公司章程和股东协议的规定，确保操作的合法性和合规性。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果协商无果，双方可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式解决纠纷。在此过程中，建议咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保障。

总结来说，大股东申请辞职而小股东不同意，这一行为本身并不直接构成违法。但具体是否违法，需结合公司章程、股东协议以及相关法律法规进行综合判断。在实际操作中，建议双方协商解决，并严格遵循相关规定和程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。