面对员工受了工伤但工伤部门不认定的情况，您可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：

一、详细了解不认定的具体原因

首先，您需要仔细阅读工伤认定决定书，明确不予认定的具体理由。这通常涉及对工伤定义的理解、证据材料的充分性、申请流程的合规性等方面的考量。只有明确了问题所在，才能有针对性地采取后续措施。

二、补充与完善证据材料

根据不认定的具体原因，积极补充或完善相关的证据材料。这可能包括：

• 医疗记录：确保有完整的医疗诊断证明，详细记录伤情、治疗过程及预后情况。
• 事故现场照片：如果可能，拍摄事故现场的照片，以直观展示事故发生的场景。
• 目击者证言：寻找事故发生时的目击者，并获取他们的书面证言或录音证言。
• 工作记录：提供与工作相关的时间表、任务分配记录等，以证明伤情与工作之间的关联性。
• 监控视频：如果工作场所或事故现场有监控视频，应尽快获取并保存相关片段。

在完善了证据材料后，您可以按照规定流程再次向工伤部门提出工伤认定申请，并附上新的、更加充分的证据材料。

三、申请行政复议

如果您认为不予认定的决定有误，且补充证据后仍未得到认定，您可以在法定期限内（通常为自知道该具体行政行为之日起六十日内，但需注意地区差异）向作出认定决定的上一级劳动管理部门或同级人民政府申请行政复议。在申请时，需准备以下材料：

• 行政复议申请书；
• 申请人身份证明；
• 工伤认定决定书；
• 相关证据材料，以证明不予认定工伤决定存在错误。

四、提起行政诉讼

若对行政复议结果不满，或者您选择直接提起行政诉讼，您应在法定期限内（若直接提起诉讼，为自知道或应当知道作出行政行为之日起六个月内；若经过行政复议，为收到复议决定书之日起十五日内）向人民法院提起诉讼。提起诉讼时，需准备以下材料：

• 行政起诉状；
• 原告身份证明；
• 工伤认定决定书；
• 行政复议决定书（如果经过了行政复议）；
• 相关证据材料，以支持自己的诉讼请求。

五、寻求其他救济途径

• 劳动争议仲裁：若因劳动关系存在争议影响了工伤认定，您可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以确认劳动关系。一旦劳动关系得以确认，您可依据新结论再次申请工伤认定。
• 寻求工会帮助：工会组织有维护职工合法权益的职责。您可向单位工会或当地总工会反映情况，以获得法律咨询、协助收集证据、与相关部门沟通协调等方面的支持。

六、咨询专业律师

在整个过程中，由于法律程序的复杂性和专业性，强烈建议您咨询专业律师。律师能够根据您的具体情况，提供准确、全面的法律指导，帮助您分析案情、准备证据材料，并与工伤部门或法院进行有效沟通，从而提高维权的效率和成功率。

综上所述，面对工伤部门不认定工伤的情况，您应保持冷静和理性，详细了解不认定原因，积极补充证据，合理利用法律途径和其他救济措施，并在专业律师的帮助下，更有效地维护自己的合法权益。