员工加班费用通过微信支付，在符合一定条件下是合法的。以下从不同角度为您详细分析：
合法性角度
支付方式的有效性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬，包括加班费。法律并未明确规定支付方式必须为银行转账或现金，因此，只要双方达成一致，且支付行为真实、可追溯，微信支付作为一种电子支付方式，是可以被接受的。
支付记录的保存：
- 微信支付具有交易记录可查询的特点，这有助于双方在发生争议时提供证据。用人单位应确保支付记录的完整性和真实性，以便在需要时作为证明加班费已支付的依据。
注意事项角度
劳动合同或规章制度中的约定：
- 用人单位应在劳动合同或规章制度中明确加班费的支付方式和时间。如果约定通过微信支付，则应确保劳动者同意并知晓该支付方式。
支付的安全性：
- 微信支付虽然方便，但也存在安全风险。用人单位应确保支付账户的安全，防止因账户被盗或信息泄露导致的支付问题。
劳动者的确认：
- 在每次支付加班费后，用人单位最好要求劳动者进行确认，如通过回复微信消息或签署确认书等方式，以确保双方对支付金额和支付时间无异议。
违法后果角度
- 如果用人单位未按照劳动合同约定或国家规定支付加班费，无论采用何种支付方式，都构成违法行为。劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位支付拖欠的加班费及可能的经济补偿。
实践建议
- 明确约定：在劳动合同或规章制度中明确加班费的支付方式和时间，确保双方权益。
- 保留证据：妥善保存微信支付记录，以便在发生争议时提供证据。
- 及时沟通：在支付加班费后，及时与劳动者沟通确认，避免不必要的纠纷。
总结来看，员工加班费用通过微信支付在符合一定条件下是合法的，但用人单位应确保支付方式的合法性、安全性和可追溯性。如果您在加班费支付方面遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。