在总价包干合同中，变更估价原则及程序是确保合同双方权益、合理调整合同价款的重要环节。以下是对变更估价原则及程序的详细阐述：
变更估价原则
工程变更引起已标价工程量清单项目变化估价原则：
- 当工程变更导致已标价的工程量清单项目发生变化时，应依据合同约定的计价方式或市场价格，对变更部分进行重新估价。这确保了变更后的项目价格能够反映实际成本和市场情况。
工程变更引起施工方案改变，造成措施项目变化的估价原则：
- 若工程变更导致施工方案改变，进而影响措施项目（如临时设施、安全措施等）的费用，应根据变更后的施工方案和实际措施费用进行重新估价。这有助于准确反映因变更而产生的额外成本。
工程变更项目，中标清综合单价与发包人招标控制价偏差较大的估价原则：
- 当工程变更项目的中标综合单价与发包人招标控制价存在较大偏差时，应依据合同约定或双方协商，对变更项目进行合理估价。这避免了因单价偏差过大而导致的合同价款不合理调整。
工程变更删减了合同中的某项工作或工程的估价原则：
- 若工程变更删减了合同中的某项工作或工程，应根据删减部分对合同总价的影响，以及删减后剩余工作的实际成本，进行合理估价。这确保了合同价款的调整既公平又合理。
因变更引起的工程量偏差较大时的估价原则：
- 当工程变更导致工程量偏差较大时，应根据实际完成的工程量和合同约定的计价方式，对变更部分进行重新估价。这有助于准确反映因工程量变化而产生的成本变动。
变更估价程序
提交工程变更申请报告：
- 合同一方（通常为承包人）在发现需要变更时，应首先向发包人提交工程变更申请报告，说明变更的原因、内容和影响。
填报变更原因、相关图纸和变更工程量和造价等：
- 在提交变更申请报告时，应同时填报变更原因、相关图纸（如设计变更图、施工变更图等）以及变更后的工程量和造价估算。这有助于发包人全面了解变更情况，并作出合理决策。
双方协商与确认：
- 发包人收到变更申请报告后，应与承包人进行协商，就变更内容、估价原则和估价结果等达成一致意见。协商过程中，双方应充分沟通、交换意见，确保变更估价结果的公平性和合理性。
执行工程变更：
- 经双方协商确认后，承包人应按照工程变更通知令执行工程变更。在执行过程中，承包人应严格按照变更后的施工方案和计价方式进行施工和计价，确保工程质量和合同价款的准确调整。
在实际操作中，合同双方应严格遵守变更估价原则和程序，确保合同价款的合理调整。若遇到复杂或争议较大的变更情况，建议及时咨询专业律师以获取法律支持和建议。如有任何法律问题，可直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。