核心结论：当生效民事判决认定的借款被后来生效的刑事判决认定为非法集资款时，法院一般会根据不同情况采取撤销原民事判决、中止执行、追缴或责令退赔等处理方式。以下是具体分析：

1. 撤销原民事判决并驳回起诉：

   • 法律依据：根据《最高人民法院关于在审理经济纠纷案件中涉及经济犯罪嫌疑若干问题的规定》第十一条，人民法院作为经济纠纷受理的案件，经审理认为不属经济纠纷案件而有经济犯罪嫌疑的，应当裁定驳回起诉，将有关材料移送公安机关或检察机关。
   • 处理方式：若民事判决生效后，刑事判决认定该借款行为构成非法集资犯罪，法院可能会通过审判监督程序撤销原民事判决，并裁定驳回原告的起诉，将案件移送公安机关或检察机关处理。

2. 中止执行并等待刑事判决结果：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十七条，作为被执行人的公民因生活困难无力偿还借款，无收入来源，又丧失劳动能力的，人民法院裁定中止执行。在非法集资案件中，若民事判决的执行可能影响刑事案件的审理或财产处置，法院可能会中止执行。
   • 处理方式：在刑事判决生效前，法院可能会中止民事判决的执行，等待刑事判决的结果。若刑事判决认定借款为非法集资款，并责令退赔给集资参与人，则民事判决的债权人可能无法再通过民事执行程序获得赔偿。

3. 追缴或责令退赔：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第六十四条，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还。
   • 处理方式：在刑事判决中，法院会责令犯罪分子退赔非法集资款给集资参与人。若民事判决的债权人同时也是集资参与人，其可能通过刑事退赔程序获得部分或全部赔偿。但需注意，刑事退赔程序通常优先于民事执行程序。

4. 参与刑事退赔程序：

   • 操作方式：债权人作为集资参与人，应向公安机关报案，并提交相关证据材料。在刑事案件审理过程中，债权人可以申报债权，参与刑事退赔程序。
   • 注意事项：债权人需密切关注刑事案件的进展，及时申报债权，并按照法院的要求提供相关证据材料。同时，债权人应了解刑事退赔程序可能存在的风险，如退赔比例、退赔时间等。

特殊场景提醒：

• 若民事判决的债权人并非集资参与人，而是与犯罪分子存在其他民事纠纷，其可能无法通过刑事退赔程序获得赔偿。此时，债权人需考虑通过其他法律途径维护自身权益。
• 在处理此类案件时，债权人应咨询专业律师，了解自身权益和可能的法律风险，以便制定合理的维权策略。

行动建议：

• 若您遇到此类情况，建议及时收集相关证据材料，并向法院或公安机关咨询具体处理流程。
• 密切关注刑事案件的进展，及时参与刑事退赔程序，以维护自身合法权益。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。