在合同纠纷中，能否起诉签字的员工需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、员工以个人身份签字

若员工以个人身份在合同上签字，且合同内容与该员工个人行为紧密相关，例如借款合同等，员工作为一方当事人签署合同，那么在这种情况下，可以直接起诉签字员工。因为员工作为合同的一方，有义务按照合同约定履行相关责任，若未履行，则需承担相应的法律责任。

二、员工代表公司签字

1. 正常授权情况：当员工是公司法定代表人或者获得公司明确授权的代表，在合同上签字时，通常起诉对象是公司，而不是签字员工个人。因为员工在此情况下是代表公司行使职权，其法律后果应由公司承担。

2. 越权代理情况：不过，如果员工存在越权代理等行为，即员工在没有获得公司授权或者超越授权范围的情况下，以公司名义签订合同，并给合同相对方带来了损失，那么相对方可以按照相关规定，要求签字员工承担责任。员工承担责任后，可再向公司追偿。这是因为员工在越权代理的情况下，其行为已经超出了公司的授权范围，应自行承担相应的法律后果。

三、法律依据与举证责任

1. 法律依据：

   • 若员工以个人名义签订合同，依据《民法典》合同编相关规定，可起诉该员工追究违约责任。
   • 若员工存在无权代理、表见代理等情形，导致合同纠纷，可根据《民法典》关于代理的规定起诉员工。例如，员工无代理权却以公司名义签订合同，公司不追认的，可起诉员工要求其承担相应民事责任。
   • 若员工在合同履行中存在故意或重大过失，造成损失，符合侵权责任构成要件的，可依《民法典》侵权责任编起诉该员工要求赔偿。

2. 举证责任：在起诉签字员工时，需要提供充分的证据证明员工的签字行为与合同纠纷之间的关联性，以及员工在合同中的具体角色和责任。例如，需要提供合同原件、签字员工的身份证明、授权委托书（如有）、越权代理的证据等。

四、实际案例分析

以小朱与某公司签订合同为例，该合同由员工小李签字。后合同履行出现纠纷，小朱认为小李作为签字人应承担责任，欲起诉小李。小李称自己是公司授权代表，起诉对象应是公司。小朱则质疑小李可能存在越权代理行为。在此情况下：

1. 若小李是以个人身份签字，且合同内容与他个人行为紧密相关，小朱可以直接起诉小李。

2. 若小李是公司法定代表人或授权代表，通常起诉对象应为公司。但如果小李存在越权代理给小朱造成损失，小朱可依据表见代理规定要求小李担责，小李担责后可向公司追偿。

总结与建议：

在合同纠纷中，能否起诉签字的员工关键在于明确签字员工在合同中扮演的角色，以及其行为和合同纠纷的关联程度。因此，在遇到类似情况时，建议先收集相关证据，明确签字员工的身份和责任，再根据具体情况决定是否起诉以及起诉的对象。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。