中医诊所一人一方做胶囊是否违法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行详细分析：
一、合法情形
根据《中医药法》的相关规定，医疗机构（包括中医诊所）用传统工艺配制的中药制剂品种，无需取得制剂批准文号，但需要向医疗机构所在地省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门备案。具体来说：
备案要求：中医诊所等医疗机构应用传统工艺配制的中药制剂，需向所在地药品监督管理部门备案。备案后，即可在本医疗机构内配制和使用，无需取得制剂批准文号。
使用范围：备案的中药制剂品种限于在取得该制剂品种备案号的医疗机构使用，一般不得调剂使用。如需调剂使用，需按照国家相关规定执行。
禁止行为：备案的中药制剂不得在市场上销售或变相销售，不得发布医疗机构制剂广告。
若中医诊所按照上述规定进行备案，并严格遵守使用范围和禁止行为，则一人一方做胶囊的行为是合法的。
二、违法情形
若中医诊所未按照《中医药法》的规定进行备案，或者未按照备案材料载明的要求配制中药制剂，则可能面临法律责任。具体来说：
未备案或备案虚假材料：根据《中医药法》第五十六条，举办中医诊所、炮制中药饮片、委托配制中药制剂应当备案而未备案，或者备案时提供虚假材料的，由中医药主管部门和药品监督管理部门按照各自职责分工责令改正，没收违法所得，并处三万元以下罚款，向社会公告相关信息；拒不改正的，责令停止执业活动或者责令停止炮制中药饮片、委托配制中药制剂活动，其直接责任人员五年内不得从事中医药相关活动。
未按照备案要求配制：医疗机构应用传统工艺配制中药制剂未依照本法规定备案，或者未按照备案材料载明的要求配制中药制剂的，按生产假药给予处罚。这意味着，若中医诊所未按照备案要求配制中药胶囊，可能面临生产假药的法律责任。
造成损害的责任：若因配制的中药制剂品种给患者造成损害，中医诊所应承担相应的损害赔偿责任。这包括医疗费、护理费、精神抚慰金等各项损失。
在实际案例中，已有中医诊所因未备案或未按照备案要求配制中药制剂而被处罚的先例。例如，某村卫生室因自制中药胶囊未备案，且该胶囊与患者慢性肾功能衰竭之间存在一定的因果关系，最终被法院判决赔偿患者部分损失。
三、建议与风险提示
严格遵守法律法规：中医诊所应严格遵守《中医药法》等相关法律法规，确保一人一方做胶囊的行为合法合规。
及时备案并遵守要求：若需配制中药制剂，应及时向所在地药品监督管理部门备案，并严格按照备案材料载明的要求进行配制和使用。
确保安全性：配制的中药制剂品种必须确保安全性，避免因质量问题给患者造成损害。
咨询专业律师：在涉及医疗纠纷或法律责任时，建议及时咨询专业律师，以维护自身合法权益。
中医诊所一人一方做胶囊是否违法，取决于是否遵守了相关法律法规和备案要求。作为中医诊所，应严格遵守法律法规，确保医疗行为的合法性和安全性。如有任何法律问题或疑虑，请直接向我咨询。