店员偷吃超市食品，用人单位不能随意扣工资，扣工资的合法性及数额需根据具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 扣工资的合法性前提

根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

• 若店员偷吃行为未造成实际经济损失：用人单位无权扣工资。例如，店员仅偷吃少量已过期或即将丢弃的食品，未影响超市正常销售或造成财产损失。
• 若店员偷吃行为造成实际经济损失：用人单位可要求赔偿，但需证明损失与偷吃行为的直接因果关系（如食品成本、重新采购费用等），且扣除金额需符合上述比例限制。

2. 扣工资的数额计算

假设店员月工资为5000元，当地最低工资标准为2000元：

• 若造成经济损失1000元：

  • 最多可扣：5000元×20%=1000元（未超过损失金额，按实际损失扣）。
  • 扣除后工资：5000元-1000元=4000元（高于最低工资标准，合法）。

• 若造成经济损失2000元：

  • 最多可扣：5000元×20%=1000元（低于损失金额，按比例扣）。
  • 扣除后工资：5000元-1000元=4000元（高于最低工资标准，合法）。
  • 剩余1000元损失：用人单位需通过其他途径（如协商、仲裁）追偿，不可继续扣工资。

• 若强行扣2000元：

  • 扣除后工资：5000元-2000元=3000元（虽高于最低工资标准，但超出20%比例限制，违法）。

3. 用人单位的违法风险

• 超比例扣工资：劳动者可向劳动监察部门投诉，用人单位需补发工资并可能面临罚款。
• 无合同约定扣工资：若劳动合同未明确赔偿条款，用人单位需与劳动者协商赔偿金额，协商不成可通过劳动仲裁解决。
• 以“罚款”名义扣工资：根据《企业职工奖惩条例》已废止，用人单位无权直接对劳动者罚款，只能通过赔偿经济损失的方式扣减工资。

4. 建议与注意事项

• 用人单位：应完善劳动合同条款，明确员工违规行为的赔偿责任；发现偷吃行为时，及时固定证据（如监控录像、食品缺失记录）；优先通过协商解决赔偿问题，避免法律风险。
• 劳动者：若认为扣工资不合理，可要求用人单位出具损失证明及扣款依据；协商无果可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。

总结：店员偷吃超市食品，用人单位扣工资需满足“造成实际损失”“合同约定赔偿”“扣款比例合法”三个条件。若您或用人单位遇到类似纠纷，可直接向我咨询具体处理方案。