原确权人死亡后，土地流转的承包费一般归其合法继承人所有。以下从不同角度为您详细分析：
一、土地确权与继承的基本原则
土地确权是指对土地所有权、使用权和他项权利的确认、确定。当原确权人死亡后，其土地权益（包括土地流转的承包费）将依法由其合法继承人继承。这一原则确保了土地权益在确权者离世后能够有序传承，避免了因继承问题产生的纠纷。
二、土地流转承包费的归属
一般原则：
- 在土地流转过程中，承包费是土地使用者因使用土地而支付的费用。当原确权人死亡后，其土地流转的承包费应归其合法继承人所有。这是因为承包费是土地权益的一部分，而土地权益在确权者离世后依法由继承人继承。
特殊情况：
- 如果原确权人在生前通过合法程序（如遗嘱、遗赠扶养协议等）对土地流转的承包费进行了特别安排，那么应按照其特别安排来执行。例如，如果原确权人通过遗嘱指定了承包费的受益人，那么应按照遗嘱的指定来分配承包费。
- 另外，如果土地流转合同中明确约定了承包费在原确权人死亡后的归属问题，那么应按照合同约定来执行。这体现了合同自由原则，即当事人可以在合同中自由约定各自的权利和义务。
三、实际操作中的注意事项
明确继承人：
- 在原确权人死亡后，其家庭成员应共同商议并推选出新的土地承包经营权代表人。同时，应明确各自的继承份额和土地权益分配情况，以避免后续因继承问题产生纠纷。
办理变更手续：
- 新选出的代表人需向当地乡级农村土地承包管理部门提交变更代表人和家庭人口的申请。这一申请将经过乡镇人民政府的严格审查，并在批准同意后上报至县级农村土地承包管理部门。县级管理部门将为申请人办理土地承包经营权的变更及注册手续，确保土地权益的合法转移。
遵守法律法规：
- 在整个过程中，应严格遵守相关法律法规的规定，确保土地流转和承包费分配的合法性和规范性。如果违反法律法规的规定，可能会面临法律责任和纠纷。
四、法律建议
- 提前规划：原确权人在生前可以通过合法程序（如遗嘱、遗赠扶养协议等）对土地流转的承包费进行特别安排，以避免后续因继承问题产生的纠纷。
- 咨询专业人士：在处理土地流转和承包费分配问题时，建议咨询专业律师或相关机构，以确保操作的合法性和规范性。
- 保留证据：在处理相关事宜时，应保留好相关证据（如土地流转合同、继承文件等），以备不时之需。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。