针对您提出的“公司辞退三年以上的员工怎么赔偿”这一问题，我将从合法辞退与违法辞退两个主要角度，结合具体情形为您详细分析赔偿标准。

一、合法辞退的赔偿标准

1. 协商解除劳动合同

   • 情形：用人单位与劳动者协商一致解除劳动合同。
   • 赔偿标准：用人单位应支付经济补偿金，按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。对于工作三年的员工，应支付三个月工资作为经济补偿金。
   • 计算公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资 = 3 × 月工资

2. 无过失性辞退

   • 情形：劳动者患病或非因工负伤在规定的医疗期满后不能从事原工作也不能从事由用人单位另行安排的工作，或者劳动者不能胜任工作经过培训或调整工作岗位仍不能胜任工作等。
   • 赔偿标准：用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同，但仍需按照协商解除的标准支付经济补偿金，即三个月工资。
   • 计算公式：同协商解除劳动合同。

3. 经济性裁员

   • 情形：用人单位因依照企业破产法规定进行重整等原因需要裁减人员二十人以上或裁减不足二十人但占企业职工总数百分之十以上的。
   • 赔偿标准：被裁减的员工有权获得经济补偿金，标准为每满一年支付一个月工资，因此工作三年的员工应获得三个月工资的经济补偿金。
   • 计算公式：同协商解除劳动合同。

二、违法辞退的赔偿标准

• 情形：用人单位违反法律规定解除劳动合同，如未提前通知、未支付代通知金或未依法支付经济补偿金等。
• 赔偿标准：用人单位应按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。对于工作三年的员工，如果遭遇违法辞退，应获得六个月工资的赔偿金（即三个月工资的经济补偿金的两倍）。
• 计算公式：赔偿金 = 经济补偿金 × 2 = 3 × 月工资 × 2 = 6 × 月工资

三、月工资的计算方式

• 定义：月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，包括基本工资、奖金、津贴等。
• 特殊情形：如果劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

四、无需支付补偿的情形

• 员工在试用期间被证明不符合录用条件。
• 员工严重违反用人单位的规章制度。
• 员工严重失职、营私舞弊，给用人单位造成重大损害。
• 员工被依法追究刑事责任。

五、注意事项

1. 程序合法性：用人单位辞退员工时需遵循法定程序，如提前通知、与工会协商等。
2. 个税处理：经济补偿金在当地职工平均工资三倍以内的部分免税，超出部分需按个人所得税规定缴纳。
3. 争议解决：员工对辞退决定或补偿有异议时，可与用人单位协商解决；协商不成可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服还可向人民法院提起诉讼。

综上所述，三年员工被辞退的赔偿问题需根据具体情况判断。合法辞退通常支付三个月工资的经济补偿，违法辞退则需支付六个月工资的赔偿金。如果您或您身边的人遇到此类问题，欢迎直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。