行政机关内部章程一般需要进行合法性审查，但具体审查方式和程度可能因章程性质、制定主体及适用范围的不同而有所差异。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、合法性审查的必要性
确保章程内容合法：
- 行政机关内部章程作为规范机关内部行为、管理内部事务的重要文件，其内容必须符合法律法规的规定。通过合法性审查，可以确保章程中的各项规定不违反法律、行政法规的强制性规定，从而维护法律的权威性和统一性。
保护公民、法人和其他组织的合法权益：
- 行政机关内部章程虽然主要规范机关内部行为，但其制定和实施也可能间接影响到公民、法人和其他组织的合法权益。例如，章程中关于行政机关内部决策程序、信息公开等方面的规定，就可能影响到外部主体的知情权、参与权等。因此，对章程进行合法性审查，也是保护外部主体合法权益的重要手段。
促进依法行政：
- 依法行政是行政机关的基本原则。对行政机关内部章程进行合法性审查，有助于推动行政机关在制定和实施内部规范时遵循法律原则和精神，从而促进依法行政的实现。
二、合法性审查的方式和程度
自我审查：
- 行政机关在制定内部章程时，可以自行进行合法性审查。这包括对章程内容的法律合规性进行初步判断，确保不违反法律、行政法规的强制性规定。自我审查是行政机关履行法定职责、确保内部规范合法性的重要环节。
上级机关或专门机构审查：
- 在某些情况下，行政机关制定的内部章程可能需要报请上级机关或专门机构进行合法性审查。这通常发生在章程涉及重大事项、具有广泛影响力或需要统一规范的情况下。上级机关或专门机构通过审查，可以确保下级机关制定的章程符合法律法规的要求，维护法律的统一性和权威性。
司法审查：
- 虽然行政机关内部章程主要规范机关内部行为，但在某些情况下，其合法性也可能受到司法机关的审查。例如，当章程的实施侵犯到公民、法人或其他组织的合法权益时，相关主体可以通过行政诉讼等途径请求司法机关对章程的合法性进行审查。
三、不同类型章程的审查要求
普遍适用的内部章程：
- 对于普遍适用的行政机关内部章程，如机关工作规则、人员管理制度等，由于其涉及面广、影响大，因此通常需要进行较为严格的合法性审查。这包括对章程内容的全面审查，确保其符合法律法规的要求。
特定事项或特定人员的章程：
- 对于针对特定事项或特定人员制定的内部章程，如某项具体工作的操作流程、某类人员的考核标准等，其合法性审查可能相对宽松。但即便如此，也必须确保章程内容不违反法律、行政法规的强制性规定。
四、法律建议
- 制定章程时注重合法性：行政机关在制定内部章程时，应充分考虑法律法规的要求，确保章程内容的合法性。
- 建立审查机制：行政机关可以建立内部章程的合法性审查机制，明确审查程序和标准，确保章程在制定和实施过程中符合法律法规的要求。
- 及时修改和完善：对于已经制定的内部章程，行政机关应定期进行审查和评估，及时发现并修改不符合法律法规要求的内容。
如有任何关于行政机关内部章程合法性审查的具体问题或疑虑，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。