对于机关人员长期病假不定等次的情况，应首先明确单位的具体规定，并依据相关规定进行处理，同时确保不违反《中华人民共和国劳动法》中关于劳动者休息休假权利的规定。

一. 分析病假与考核定等次的关系

1. 病假影响：长期病假可能会对机关人员的年度考核产生影响，但具体如何影响，需要参照单位的具体考核规定。
2. 考核规定：不同机关单位可能有不同的考核制度和标准，对于长期病假人员的考核定等次也会有相应的规定。因此，处理此类问题时，应首先查阅并遵循单位的具体考核规定。

二. 遵循劳动法规定

1. 休息休假权利：根据《中华人民共和国劳动法》第三条，劳动者享有休息休假的权利。这意味着，机关人员在符合规定的情况下，有权申请并享受病假。
2. 不得侵犯权利：单位在处理长期病假人员时，应确保不违反劳动法的规定，不得随意剥夺或限制其休息休假的权利。

三. 具体处理建议

1. 查阅单位规定：首先，应详细查阅单位关于病假和考核定等次的相关规定，明确长期病假人员的处理方式。
2. 与单位沟通：如果单位规定不明确或存在争议，建议与单位的人事部门或相关部门进行沟通，寻求合理的解决方案。
3. 提出申诉：如果认为单位的处理方式违反了劳动法或单位规定，可以依法提出申诉，维护自己的合法权益。

我建议，在处理机关人员长期病假不定等次的问题时，应综合考虑单位规定和劳动法规定，确保处理方式的合法性和合理性。同时，机关人员也应了解自己的权利和义务，积极与单位沟通，共同寻求合理的解决方案。如有进一步需要，您可以继续咨询我。