商家出售商品缺斤短两且质量有问题，主要触犯了消费者的以下权益：
公平交易权：
- 法律依据：根据《中华人民共和国消费者权益保护法》第十条，消费者享有公平交易的权利。这包括获得质量保障、价格合理、计量正确的公平交易条件。
- 具体情形：商家缺斤短两，即计量不准确，直接违反了公平交易的原则。消费者在购买商品时，有权获得与所支付价款相符的商品数量和质量。商家通过缺斤短两的方式，实际上是在剥夺消费者的这一权利。
知情权：
- 法律依据：同样依据《中华人民共和国消费者权益保护法》第八条，消费者享有知悉其购买、使用的商品或者接受的服务的真实情况的权利。
- 具体情形：商家出售质量有问题的商品，却未向消费者如实告知，这侵犯了消费者的知情权。消费者在购买商品时，有权了解商品的真实质量状况，以便做出明智的购买决策。商家隐瞒商品质量问题，导致消费者在不知情的情况下购买了劣质商品，显然违反了这一规定。
选择权（间接侵犯）：
- 法律依据：虽然《中华人民共和国消费者权益保护法》第九条主要规定的是消费者有权自主选择提供商品或者服务的经营者，自主选择商品品种或者服务方式等，但商家的行为也间接影响了消费者的选择权。
- 具体情形：当商家通过缺斤短两或提供劣质商品来欺骗消费者时，消费者实际上是在被误导的情况下做出了购买决定。这相当于剥夺了消费者在充分了解商品真实情况后自主选择商品的权利。虽然这种侵犯不是直接的，但商家的不诚信行为确实影响了消费者的选择自由。
针对商家行为的法律建议：
- 收集证据：消费者在遇到此类问题时，应首先收集相关证据，如购物发票、商品照片、视频等，以证明商家确实存在缺斤短两或质量问题。
- 与商家协商：在收集到足够证据后，消费者可以尝试与商家进行协商，要求商家进行退货、换货或赔偿。
- 向相关部门投诉：如果协商无果，消费者可以向当地的市场监督管理部门或消费者协会进行投诉，寻求官方帮助。
- 法律途径：在必要时，消费者还可以通过法律途径来维护自己的权益，如向法院提起诉讼。
可能面临的法律后果：
- 行政处罚：商家如果被查实存在缺斤短两或质量问题，可能会面临市场监督管理部门的行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 民事赔偿：商家还需要对消费者进行民事赔偿，包括退货款、赔偿损失等。
- 信誉损失：商家的不诚信行为还会导致其信誉受损，进而影响其未来的经营和发展。
作为消费者，在遇到此类问题时，应勇敢站出来维护自己的权益。如果您有任何法律疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。