在工伤案件执行过程中，关于赔偿金额是否应当扣减保险理赔部分，这并非一个简单的是非问题，而是需要依据具体情况和相关法律规定来综合判断。

首先，我们要明确的是，工伤保险赔偿和商业保险赔偿在法律性质上是有所不同的。工伤保险赔偿是基于劳动关系的法定赔偿，是法律规定公司必须为员工提供的保障，它体现了国家对劳动者权益的保护。而商业保险赔偿则是基于保险合同的约定赔偿，其性质和范围都取决于保险合同的具体条款。

接下来，我们分两种情况来讨论：

1. 当公司为员工缴纳了工伤保险，并额外投保了商业性人身意外伤害保险时：

   • 在这种情况下，工伤保险赔偿和商业保险赔偿并不冲突。员工既能获得工伤保险赔偿，也能拿到商业保险赔偿。这是因为两者性质不同，且法律并未规定在获得工伤保险赔偿后需要扣减商业保险赔偿。因此，公司没有理由扣除保险公司赔偿的钱。

2. 当商业保险是公司为了减少自身风险而投保，且保险合同里明确规定受益人为公司时：

   • 在这种情况下，如果员工发生工伤并获得了保险公司的赔偿，公司在支付给员工工伤赔偿时，有可能根据保险合同的约定扣除相应的保险赔款。这是因为保险合同中已经明确规定了受益人为公司，且公司投保的初衷就是为了减少自身风险。但具体能否扣除，还需要依据保险合同的具体条款和相关法律规定来确定。

以具体案例为例，如果小何是一家公司员工，工作中不幸受伤被认定为工伤。该公司为员工缴纳了工伤保险，还投保了商业性人身意外伤害保险。小何获得保险公司赔偿后，公司提出要扣除这笔赔偿款。此时，我们需要查看保险合同的具体约定。如果保险合同中并无特殊约定，即未规定受益人为公司或未规定在支付工伤赔偿时需要扣减保险赔偿，那么公司就不能扣除保险公司赔偿的钱。反之，如果保险合同中有明确约定，那么公司则可能有权扣除相应保险赔款。

综上所述，工伤案件执行过程中赔偿金额是否应当扣减保险理赔部分，关键在于保险合同的具体约定以及相关法律规定。员工和公司都应依据实际情况，按照规定处理赔偿事宜，以确保双方的合法权益得到保障。