没有施工许可证的情况下，施工单位能否索赔需分情况讨论，具体分析如下：

1. 合同效力与索赔基础

• 未取得施工许可证的合同效力：根据《建筑工程施工许可管理办法》第十二条，未取得施工许可证擅自施工的，由发证机关责令停止施工、限期改正，并对建设单位和施工单位处以罚款。但合同效力并不因未取得许可证而直接无效，除非合同内容违反法律强制性规定（如必须招标的项目未招标）。
• 索赔前提：施工单位能否索赔，关键在于合同是否有效以及是否存在违约或侵权行为。若合同有效，施工单位可依据合同约定主张工程款、违约金等；若合同无效（如因未取得许可证导致），则需按《民法典》第七百九十三条处理，即参照合同约定折价补偿。

2. 行政处罚对索赔的影响

• 行政责任与民事责任分离：施工单位因未取得许可证被行政处罚（如罚款），不影响其向建设单位主张民事权利。例如，若建设单位未支付工程款，施工单位仍可起诉要求支付。
• 但需注意：若未取得许可证导致工程被责令停工，施工单位可能因停工损失（如窝工费、材料费）向建设单位索赔，但需证明损失与停工的直接因果关系。

3. 索赔的常见情形

• 情形一：合同有效，建设单位违约
  若合同明确约定施工许可证由建设单位办理，且因建设单位原因未取得许可证导致停工，施工单位可主张：
  • 工程款：已完成部分的工程款；
  • 违约金：合同约定的逾期付款或停工违约金；
  • 损失赔偿：如停工期间的机械租赁费、人员工资等。
• 情形二：合同无效，但工程验收合格
  若合同因未取得许可证被认定无效，但工程经竣工验收合格，施工单位可参照合同约定主张工程款，但无法主张违约金（因合同无效）。
• 情形三：合同无效，且工程未验收
  若工程未验收且质量不合格，施工单位可能需承担修复责任，甚至无法获得工程款。

4. 实务建议

• 立即补办许可证：若工程已施工但未取得许可证，应尽快补办，避免被行政处罚或责令停工。
• 固定证据：保留施工合同、工程量清单、付款记录、停工通知等证据，以备索赔时使用。
• 协商或诉讼：优先与建设单位协商解决；协商不成，可依据合同约定或法律规定起诉，但需注意诉讼时效（通常为3年）。

5. 风险提示

• 行政处罚风险：未取得许可证擅自施工的，施工单位可能被处以3万元以下罚款，直接责任人员可能被处以罚款。
• 合同无效风险：若合同因未取得许可证被认定无效，施工单位可能无法主张高额违约金，仅能获得折价补偿。

总结：没有施工许可证不影响施工单位索赔的权利，但索赔的成功率和范围取决于合同效力、违约原因及证据充分性。建议施工单位在施工前确保许可证齐全，若已发生无证施工，应尽快补办并固定证据，必要时咨询专业律师制定索赔方案。如有具体案件，可直接向我咨询细节。