孙子和爷爷做亲子鉴定，不会显示孙子是爷爷的儿子。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、亲子鉴定的基本原理

亲子鉴定是通过比较被检测者（通常包括父母和子女）的DNA序列，来确定他们之间是否存在生物学上的亲子关系。在亲子鉴定中，主要关注的是父母与子女之间的遗传关系，即父亲或母亲与子女之间的DNA匹配程度。

二、孙子和爷爷的遗传关系

从遗传学的角度来看，孙子与爷爷之间隔了一代，他们之间的遗传关系是通过孙子的父亲（即爷爷的儿子）来传递的。因此，在孙子和爷爷的DNA中，虽然会存在一些共同的遗传标记，但这些标记并不足以直接证明孙子是爷爷的儿子。实际上，孙子是爷爷儿子的子女，这是基于家族关系的常识。

三、亲子鉴定的结果解读

1. 直接亲子关系：如果进行的是父亲与子女的亲子鉴定，那么结果会明确显示他们之间是否存在生物学上的父子关系。
2. 间接亲子关系：对于孙子和爷爷这样的间接亲子关系，亲子鉴定无法直接得出“孙子是爷爷的儿子”这样的结论。它只能显示孙子与爷爷之间存在一定的遗传相似性，但这种相似性并不足以证明直接的亲子关系。

四、可能的误解与澄清

有些人可能会误认为，由于孙子和爷爷之间存在遗传关系，因此亲子鉴定可能会显示某种“间接”的亲子关系。然而，实际上亲子鉴定技术是基于直接的生物学亲子关系进行设计的，它无法准确解读或证明间接的亲子关系，如祖孙关系。

五、法律建议

如果您需要进行亲子鉴定以确认某种家庭关系，建议明确鉴定目的和对象。例如，如果您想确认孙子与父亲之间的亲子关系，那么应该进行父亲与子女的亲子鉴定。如果您对亲子鉴定结果有疑问或需要进一步的法律解释，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。