若被告人不同意违章建筑以物抵债，债权人可采取以下措施来维护自身权益：

1. 核查债权债务关系：

   • 首先，债权人需要核查与被告人之间的债权债务关系是否有书面凭证，如借条、合同等，确保债权的合法性与明确性。这是后续采取任何措施的基础，因为只有合法的债权才能受到法律的保护。

2. 与被告人协商：

   • 若债权合法有效，债权人可尝试与被告人进一步协商。协商的内容可以包括调整抵债物（例如，选择其他有价值的财产进行抵债）、价格或还款计划等，以争取达成双方均可接受的方案。协商是解决纠纷的一种较为温和且高效的方式，有助于维护双方的关系并减少诉讼成本。

3. 通过法律途径解决：

   • 提起诉讼：若协商无果，且债权已到期，债权人可考虑向有管辖权的法院提起诉讼，请求法院判决被告人偿还债务。在诉讼过程中，债权人需要提供充分的证据来证明自己的债权以及被告人的违约行为。
   • 申请强制执行：在获得胜诉判决后，若被告人仍不履行还款义务，债权人可向法院申请强制执行。法院有权对被告人的财产进行查封、拍卖等措施，以实现债权。对于违章建筑，虽然其本身可能不具备合法的产权，但如果该建筑与案件有关联，且被告人无其他可供执行的财产，法院可能会根据具体情况采取相应的执行措施。不过，需要注意的是，违章建筑的处理可能受到相关行政法规的限制，法院在执行时可能会考虑这些因素。

4. 注意以物抵债协议的合法性：

   • 在整个过程中，债权人需要确保以物抵债协议（如果存在）符合法律法规的要求，不存在违反法律强制性规定、损害第三人利益等情形。如果以物抵债协议未经被告人同意或存在其他违法情形，该协议可能被认定为无效，债权人仍需按原债务履行方式要求被告人偿债。

5. 考虑抵债物的特殊情况：

   • 如果抵债物（如违章建筑）存在产权纠纷或其他特殊情况，债权人需要在处理过程中格外谨慎。在这种情况下，可能需要先解决产权纠纷或其他法律问题，才能进一步考虑以物抵债的可行性。

后续行动建议：

• 在采取任何措施之前，债权人最好先咨询专业律师的意见，以确保自己的行动合法且有效。
• 债权人应保留好所有与债权债务相关的证据和文件，以备不时之需。
• 在与被告人协商或通过法律途径解决纠纷时，债权人应保持冷静和理性，避免采取过激或违法的行为。

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