核心结论：针对经济社与村联社委托土地合同签名未达三分之二人数但已使用20年的情况，需结合合同效力、历史成因、法律程序补救及利益平衡等多维度综合处理，具体分以下方向分析：

1. 合同效力认定：未达法定比例是否导致无效？

• 法律要件：根据《民法典》第143条，合同生效需满足“行为人具有相应民事行为能力+意思表示真实+不违反法律强制性规定”。若合同签订时未达法定人数（如《村民委员会组织法》第24条规定的“涉及村民利益事项需经村民会议三分之二以上成员同意”），可能因程序违法被认定为效力待定或可撤销，但不直接导致合同无效。
• 20年使用的影响：若合同已实际履行20年，且双方长期认可其内容，法院可能依据《民法典》第140条（行为推定）或第504条（表见代理）认定合同有效，尤其当经济社或村联社已通过其他形式（如后续决议、实际收益分配）追认时。

2. 历史成因与程序补救：能否通过补签或追认完善手续？

• 补签可能性：若当前仍可召集村民会议，可尝试通过补充决议（需达法定比例）或书面追认（如全体成员签字确认）完善程序。根据《民法典》第171条，无权代理行为经被代理人追认后有效。
• 时效限制：需注意诉讼时效问题。若对方主张合同无效，应在知道或应当知道权利受损之日起3年内提起诉讼（民法典第188条）。超期可能丧失胜诉权。

3. 利益平衡与实际履行：已使用20年的处理原则

• 公平原则：法院在审理时可能适用《民法典》第6条（公平原则），综合考虑双方实际履行情况、土地使用收益分配、是否损害第三方利益等因素，判决合同继续履行或调整条款（如租金、期限）。
• 行政干预风险：若土地涉及集体利益或规划调整，可能面临自然资源部门的监管。建议提前与相关部门沟通，避免因程序瑕疵被认定为“非法用地”。

4. 操作建议：分步骤化解风险

• 第一步：内部核查：梳理合同签订时的会议记录、签字文件，确认未达比例的具体环节（如是否通知全体成员、是否存在代签）。
• 第二步：补救程序：尽快召集村民会议，通过补充决议或追认文件完善手续。若无法召集，可考虑与村联社协商签订补充协议，明确双方权利义务。
• 第三步：法律备案：将补救后的合同或决议报乡镇政府备案，增强合法性。
• 第四步：风险隔离：若对方主张无效，可主张“信赖利益保护”，要求赔偿因合同履行产生的合理支出（如土地改良费用）。

总结：未达三分之二人数签订的合同不必然无效，但需通过补救程序或实际履行情况争取法院支持。建议优先协商补签，若协商不成，及时委托律师分析证据链，制定诉讼策略。如有进一步细节需讨论，可直接向我提问。