是的，行政许可事项调查需要延期时，应当告知当事人。以下是对此问题的详细解释：
一、法律依据
根据《中华人民共和国行政许可法》第四十二条的规定：“除可以当场作出行政许可决定的外，行政机关应当自受理行政许可申请之日起二十日内作出行政许可决定。二十日内不能作出决定的，经本行政机关负责人批准，可以延长十日，并应当将延长期限的理由告知申请人。” 这一条款明确规定了行政机关在无法按时作出行政许可决定时，需要延长办理期限并告知申请人的法律义务。
二、告知当事人的重要性
保障知情权：告知当事人延长期限的理由，是保障其知情权的重要体现。当事人有权了解行政许可事项的办理进度和可能存在的延误原因。
维护合法权益：通过告知，当事人可以及时调整自己的计划或安排，避免因行政许可事项的延误而遭受不必要的损失。
增强行政透明度：公开延长期限的理由，有助于增强行政许可过程的透明度，提升公众对行政机关的信任度。
三、实际操作中的注意事项
及时告知：行政机关应在决定延长办理期限后，尽快将延长期限的理由告知当事人，避免因信息传递不及时而给当事人带来困扰。
书面告知：为了确保告知的准确性和可追溯性，建议行政机关采用书面形式告知当事人延长期限的理由。
记录留存：行政机关应妥善留存告知当事人的相关记录，以备后续查询或审计之需。
四、特殊情况下的处理
对于统一办理、联合办理或集中办理的行政许可事项，如果四十五日内不能办结，经本级人民政府负责人批准，可以延长十五日，并应当将延长期限的理由告知申请人。这种情况下，告知当事人的义务同样适用。
总结与建议：
行政许可事项调查需要延期时，行政机关应当告知当事人延长期限的理由。这是法律规定的义务，也是保障当事人知情权、维护其合法权益、增强行政透明度的重要举措。在实际操作中，行政机关应注意及时、书面地告知当事人，并妥善留存相关记录。如果您在行政许可事项中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。