当公司劳动合同主体发生变更时，您是否可以申请经济补偿，这主要取决于变更的具体情况和原因。以下是对此问题的详细分析：
可以申请赔偿的情形
协商一致解除原合同并重新签订：
- 如果用人单位与您协商一致，解除了原劳动合同，并与新主体重新签订了劳动合同，根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当向您支付经济补偿。补偿标准通常按照您在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准来计算。
因客观情况发生重大变化导致合同无法履行且未就变更达成一致：
- 当劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，如公司搬迁、业务调整等，导致原劳动合同无法继续履行，且经用人单位与您协商未能就变更劳动合同内容达成协议时，用人单位应支付经济补偿。
用人单位存在违法违规操作：
- 如果用人单位以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使您在违背真实意思的情况下变更劳动合同主体，您有权请求撤销该变更行为，并要求用人单位承担相应赔偿责任。
不可以申请赔偿的情形
合法承继权利义务：
- 根据《劳动合同法》的规定，用人单位发生合并或者分立等情况时，原劳动合同继续有效，由承继其权利和义务的用人单位继续履行。在这种情况下，仅仅是劳动合同的主体发生了变更，但您的工作岗位、工作内容、工资待遇等基本劳动条件并未发生改变，因此您通常不能获得经济补偿。
双方自愿协商变更：
- 如果您与用人单位经过平等、自愿的协商，一致同意变更劳动合同主体，并且双方在变更过程中没有受到欺诈、胁迫等不正当因素的影响，那么这种变更是合法有效的，您一般也不能要求经济补偿。
经济补偿的计算标准
- 计算基数：经济补偿按您在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向您支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向您支付半个月工资的经济补偿。月工资是指您在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
- 高限限制：如果您的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向您支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
应对建议
- 当您面临劳动合同主体变更的情况时，首先应判断变更是否合法，并了解自己的权益是否受到损害。
- 如果变更行为合法且未对您造成不利影响，您可以考虑接受变更。
- 如果变更行为违法或对您造成了不利影响，您有权拒绝变更，并可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向劳动争议仲裁机构申请仲裁等。
综上所述，劳动合同主体变更时是否可以申请经济补偿，取决于变更的具体情况和原因。在面临此类情况时，建议您仔细了解相关法律法规，并咨询专业人士的意见，以维护自己的合法权益。