如果发现公司通过第三方发放的工资多发了，这通常意味着存在误发或多发工资的情况。针对这一问题，你可以按照以下步骤来处理：

一、核实工资情况

首先，你需要仔细核对你的工资条或银行账户明细，确认是否确实存在误发或多发的情况。这包括与第三方公司或公司的财务部门进行沟通，了解工资发放的详细情况，并对比你与公司签订的劳动合同或协议中约定的工资待遇。

二、与第三方公司协商

如果确认存在误发或多发工资的情况，你应及时与第三方公司进行协商。在协商过程中，你可以：

1. 说明情况：向第三方公司详细说明你发现的工资多发情况，并提供相关证据，如工资条、银行账户明细等。
2. 寻求解决方案：与第三方公司共同探讨妥善的解决方案。例如，你可以提议将多发的工资在后续月份中进行抵扣，或者由第三方公司直接收回多发的部分。
3. 保持沟通：在协商过程中，保持与第三方公司的良好沟通，确保双方对解决方案达成一致。

三、法律依据与权利保护

在处理此类问题时，你应依据《中华人民共和国民法典》的相关规定来保护自己的合法权益。根据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。因此，如果第三方公司无法就误发或多发的工资与你达成协议，你有权要求其返还多发的部分。

四、寻求法律援助（如需）

如果与第三方公司的协商未能达成一致，或者第三方公司拒绝返还多发的工资，你可以考虑寻求法律援助。你可以：

1. 咨询律师：找一位专业的律师咨询，了解你的法律权益和可能的维权途径。
2. 提起民事诉讼：如果必要，你可以向法院提起民事诉讼，要求第三方公司返还多发的工资。在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来支持你的主张。

五、预防措施

为了避免类似情况再次发生，你可以采取以下预防措施：

1. 定期核对工资：定期核对你的工资条和银行账户明细，确保工资发放的准确性。
2. 保留相关证据：保留与工资发放相关的所有证据，如工资条、银行账户明细、劳动合同等。
3. 及时沟通：如果发现工资发放存在异常，及时与第三方公司或公司的财务部门进行沟通，以便及时解决问题。

总之，如果发现公司通过第三方发放的工资多发了，你应首先核实工资情况，然后与第三方公司进行协商，并依据相关法律法规来保护自己的合法权益。如果协商无果，你可以考虑寻求法律援助。同时，为了预防类似情况再次发生，你可以采取一些预防措施。