针对您提出的“建造师挂证协议无效，企业能否把挂证费要回来”的问题，我们可以从法律角度和实际案例出发进行详细分析。

首先，我们需要明确的是，建造师挂证行为本身是违法的。根据住建部发布的《注册建造师管理规定》，注册建造师资格证书不得出租、出借或者以其他形式非法转让资格证书、注册证书。这种“人证分离”的挂证行为，不仅扰乱了建筑市场秩序，还违背了社会公序良俗，对工程质量和安全构成潜在威胁，损害了国家和社会公共利益。

接下来，我们结合实际案例来进一步说明。在赣州经开区人民法院审理的一起相关案件中，胡某将其人防防护工程师证书及执业印章挂靠到赣州某人防公司并获取报酬，双方签订了挂靠协议。然而，法院审理后认为，该协议因违反国家法律、行政法规的强制性规定而属于无效合同。因此，对于胡某要求被告支付挂靠费的诉讼请求，法院不予支持。这表明，在挂证协议无效的情况下，企业无需支付挂证费，且如果已经支付，理论上也无法通过法律手段强制要求对方返还（但实际中可能因具体情况有所不同，如企业可尝试通过协商或法律途径追回已支付费用，但成功与否需视具体情况而定）。

再来看另一个案例，鼓楼区法院审结的一起委托合同纠纷中，原告作为挂证中介公司，起诉要求判令与被告签订的委托协议无效并要求被告退还服务费。法院最终判决支持了原告诉请，认为涉案挂证中介之间签订的委托协议目的在于通过挂证行为获取利益，该行为扰乱了建筑市场秩序，违背社会公序良俗，因此委托协议无效，被告需退还原告支付的服务费用。

综合以上分析，我们可以得出以下结论：在建造师挂证协议无效的情况下，企业不仅无需支付挂证费，而且如果已经支付了挂证费，虽然法律上可能无法直接强制要求对方返还（因为挂证行为本身违法，合同自始无效，但返还请求需视具体情况和法律规定），但企业可以通过协商、投诉或法律途径（如起诉要求返还因无效合同取得的财产）来尝试追回已支付的费用。不过，更重要的在于，企业应遵守法律法规，避免参与挂证等违法行为，以免面临法律风险和声誉损失。

因此，对于您的问题，答案是：在建造师挂证协议无效的情况下，企业理论上无需支付挂证费，且如果已经支付，可尝试通过合法途径追回，但更应注重遵守法律法规，避免参与违法行为。