劳务派遣合同中的加班费，一般由用工单位承担支付责任。以下从不同角度为你详细分析：
法律规定角度
根据《中华人民共和国劳动合同法》第六十二条，用工单位应当履行多项义务，其中就包括“支付加班费、绩效奖金，提供与工作岗位相关的福利待遇”。这意味着，从法律层面明确规定了用工单位在劳务派遣关系中，有支付加班费的法定义务。因为加班是基于用工单位的工作安排产生的，用工单位掌握着劳动者加班的具体情况和信息，所以由其承担支付加班工资的责任是合理且合法的。
合同约定角度
虽然法律规定了用工单位支付加班费的一般原则，但劳务派遣单位与用工单位在劳务派遣协议中，也可以对加班工资支付作出其他约定。不过，这种约定必须遵循一个重要前提，即不得损害被派遣劳动者的合法权益。例如，双方不能约定完全免除用工单位支付加班费的责任，或者将支付责任不合理地转嫁给劳务派遣单位，从而损害劳动者的利益。如果协议中有这样的不合理约定，该约定将被视为无效，仍然应按照法律规定，由用工单位承担支付加班费的责任。
实际案例角度
以一个实际案例来说明，小朱是一名劳务派遣人员，被派遣到小许所在的单位工作。在工作期间，小许所在单位经常安排小朱加班，但从未支付加班费。小朱找到劳务派遣公司要求支付加班费，劳务派遣公司认为应由用工单位支付；而小许所在单位则称应是劳务派遣公司支付，双方因此产生争议。在这个案例中，依据《劳动合同法》，劳务派遣单位是用人单位，要履行对劳动者的义务，而用工单位负责实际使用劳动者。《劳动合同法》第62条明确规定，用工单位应向被派遣劳动者支付加班费、绩效奖金，提供与工作岗位相关的福利待遇。加班费与用工单位工作安排直接相关，派遣单位主要承担订立合同、支付工资等义务。所以，小朱的加班费应由小许所在的用工单位支付。
特殊情况角度
如果劳务派遣单位与用工单位在协议中明确约定了加班费由劳务派遣单位支付，并且这种约定没有损害被派遣劳动者的合法权益，那么在这种情况下，加班费可能由劳务派遣单位支付。但这种情况比较少见，因为劳务派遣单位通常只是负责与劳动者订立劳动合同，并将劳动者派往用工单位工作，并不直接管理劳动者的工作安排和加班情况。而且，如果由劳务派遣单位支付加班费，可能会增加其运营成本，也不利于保障劳动者的权益。所以，在实际操作中，大多数情况下还是由用工单位支付加班费。
建议：
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