针对您提出的“超过12个月停工留薪期员工申请延长停工留薪期并申请劳动能力鉴定”的问题，以下是一份详细的申请指南及申请书撰写建议：

一、申请背景与依据

根据《工伤保险条例》（中华人民共和国国务院令第586号）第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月。若伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。

二、申请条件

1. 员工已享受满12个月的停工留薪期。
2. 员工伤情严重或情况特殊，仍需继续治疗或休养。
3. 员工已进行工伤认定，并持有《工伤认定决定书》。

三、申请材料

在申请延长停工留薪期并申请劳动能力鉴定时，您需要准备以下材料：

1. 《工伤认定决定书》复印件：证明员工已遭受工伤并经过认定。
2. 身份证复印件：证明员工的身份。
3. 有效的诊断证明、病历材料：包括医疗机构出具的诊断书、病历、检查报告等，证明员工伤情严重或情况特殊，仍需继续治疗或休养。
4. 《停工留薪期延长申请表》（或类似名称的表格）：此表格通常由当地人社局或劳动能力鉴定委员会提供，用于填写员工的个人信息、工伤情况、延长停工留薪期的理由等。

四、申请书撰写建议

在撰写《停工留薪期延长申请表》或相关申请书时，您可以参考以下结构：

标题：停工留薪期延长申请书

正文：

1. 员工基本信息：包括姓名、性别、年龄、身份证号码、工作单位及职务等。
2. 工伤情况概述：简要描述员工遭受工伤的时间、地点、原因及伤情。
3. 已享受停工留薪期情况：说明员工已享受的停工留薪期时长及期间的治疗情况。
4. 申请延长停工留薪期的理由：详细阐述员工伤情严重或情况特殊的具体表现，如持续疼痛、功能障碍、需要进一步手术或康复治疗等，并说明这些情况对员工工作能力的影响。
5. 申请劳动能力鉴定的请求：明确表示希望劳动能力鉴定委员会对员工的劳动能力进行鉴定，以确定是否需要继续延长停工留薪期。
6. 附件材料清单：列出随申请书一同提交的所有附件材料。

结尾：表达对劳动能力鉴定委员会的感谢，并期待尽快得到回复。

签名与日期：员工本人签名及申请日期。

五、办理方式与流程

1. 办理方式：您可以选择现场提交或邮寄提交申请材料。
2. 办理流程：
   • 提交申请材料至当地人社局或劳动能力鉴定委员会指定的窗口。
   • 工作人员审核材料是否准确、完整，符合受理范围的予以受理。
   • 劳动能力鉴定委员会组织专家对员工进行劳动能力鉴定。
   • 根据鉴定结果，劳动能力鉴定委员会做出是否延长停工留薪期的决定，并将结果送达员工或其所在单位。

六、办理时限与结果送达

1. 办理时限：通常为1个工作日（具体时限可能因地区而异，请以当地规定为准）。
2. 结果送达：结果可以通过现场领取或邮寄方式送达。

七、注意事项

1. 请确保提交的所有材料真实、准确、完整。
2. 如有任何疑问或需要进一步的帮助，请及时联系当地人社局或劳动能力鉴定委员会。

希望以上信息能对您有所帮助。在撰写申请书和准备材料时，请务必仔细、认真，以确保申请的顺利进行。