公司运营中同时使用2枚公章是严重违法的行为，且存在显著的管理和法律风险。以下从不同角度详细分析这一行为的法律责任及后果：
一、合法性问题
正常情况下，公司应仅持有一枚经公安机关备案的公章，该公章具有最高的法律效力。若公司未经备案私自刻制多枚公章，可能涉嫌违法。根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十二条，伪造、变造或者买卖国家机关、人民团体、企业、事业单位或者其他组织的公文、证件、证明文件、印章的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款；情节较轻的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款。
二、法律效力问题
- 备案公章：在各类民事法律行为、经济往来、诉讼活动中具有当然的法律效力。
- 未经备案公章：其效力认定复杂。若相对人有合理理由相信该公章代表公司意思表示，或公司进行了追认，则可能被认定为有效；否则，可能不对公司具有约束力。但无论如何，使用未经备案的公章都会引发合同效力争议，让交易方产生不信任，从而影响公司的正常商业活动。
三、管理混乱与法律责任不清
多枚公章可能导致公司内部管理混乱，文件、合同等法律文件不一致，难以追踪。在法律纠纷中，多枚公章更可能导致责任归属不明确，难以追究相关人员的法律责任。例如，若因使用两套公章引发纠纷，给公司或交易相对方造成损失，相关责任人可能要承担民事赔偿责任。
四、欺诈风险
多枚公章增加了被不法分子盗用或滥用的风险，可能被用于签署虚假合同、伪造文件等违法行为。这不仅会损害公司的声誉和利益，还可能使公司面临法律诉讼和刑事处罚。
五、法律后果与建议
法律后果：
- 民事责任：因使用两套公章引发纠纷，若给公司或交易相对方造成损失，相关责任人可能要承担民事赔偿责任。
- 刑事责任：若情节严重，相关责任人可能涉嫌伪造公司印章罪，面临三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金的刑事处罚。
建议措施：
- 统一公章管理：公司应建立严格的公章管理制度，确保仅持有一枚合法有效的公章（或明确少数几枚公章的具体用途和使用权限）。公章应由专门的部门或人员负责保管和使用，并登记每次使用的详细情况。
- 加强内部控制：确保公章的使用符合公司的授权和审批流程，对于需要使用公章的文件或合同，应经过相关部门或人员的审核和批准。
- 法律风险防范：在使用公章时，应严格遵守相关法律法规和合同约定。对于重要的法律文件，建议咨询专业律师进行审查和指导。
- 定期审计与检查：定期对公章的使用情况进行审计和检查，及时发现和纠正存在的问题。
- 及时清理与备案：对于不再使用的公章，应及时按照规定程序进行销毁，并办理相关备案注销手续。如果有新的业务用章需要启用，要确保依法依规进行备案。
公司运营中应严格遵守公章管理规定，避免同时使用多枚公章带来的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。