同一人代表两家分别投标一个项目的两个部分，一般情况下是不合规的。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、法律法规角度

根据《政府采购法实施条例》第十八条的规定，“单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得参加同一合同项下的政府采购活动”。这一规定旨在防止供应商之间通过关联关系进行不正当竞争，损害公共利益。虽然该条例直接针对的是政府采购活动，但其中的原则和精神同样适用于其他类型的招投标活动，尤其是当招投标活动涉及公共利益或公平竞争时。

在招投标活动中，如果同一人代表两家或多家存在关联关系的供应商参与同一项目的不同部分投标，这很可能构成对上述规定的违反。因为这种行为可能导致投标过程中的不公平竞争，损害其他投标人的利益，同时也可能影响项目的质量和进度。

二、实际操作角度

从实际操作的角度来看，同一人代表两家分别投标一个项目的两个部分，也会给招投标活动带来诸多不便和风险。例如：

1. 利益冲突：同一人代表两家供应商，可能难以保持中立和公正，容易在投标过程中出现利益输送或偏袒某一方的情况。
2. 管理混乱：两家供应商在投标过程中可能需要共享某些资源或信息，这可能导致管理上的混乱和效率低下。
3. 法律风险：如果这种行为被认定为违规，两家供应商都可能面临无效投标、罚款甚至更严重的法律后果。

三、合规建议

为了避免上述风险和问题，建议采取以下措施：

1. 避免关联关系：在参与招投标活动时，应确保供应商之间不存在关联关系，尤其是单位负责人为同一人或存在直接控股、管理关系的情况。
2. 明确投标主体：每个投标主体应独立参与投标活动，不得由同一人代表多家供应商进行投标。
3. 加强合规审查：在招投标活动前，应对投标主体的资格和合规性进行严格审查，确保符合相关法律法规和招投标文件的要求。

总结来说，同一人代表两家分别投标一个项目的两个部分，在法律法规和实际操作层面都存在不合规的风险。因此，建议投标人在参与招投标活动时，应严格遵守相关法律法规和招投标文件的要求，确保投标活动的公平、公正和合法。如果您在招投标活动中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。