养猪场非法排放粪污，一般由生态环境主管部门（即各地的生态环境局）负责处理。以下从法律角度详细分析：
一、法律依据与职责划分
根据《畜禽规模养殖污染防治条例》和《中华人民共和国水污染防治法》的相关规定，从事畜禽养殖活动或畜禽养殖废弃物处理活动时，必须采取有效措施防止废弃物渗出、泄漏，且排放水污染物不得超过国家或地方规定的标准。若养猪场非法排放粪污，违反了上述法规，将面临生态环境主管部门的处罚。
生态环境主管部门（如各地的生态环境局）负责监督和管理环境违法行为，包括养猪场的非法排放行为。一旦发现此类行为，生态环境主管部门将进行调查取证，并根据违法情节的严重程度，依法作出责令改正、罚款等行政处罚决定。
二、处罚措施与程序
调查取证：生态环境主管部门在接到举报或发现养猪场非法排放粪污后，将立即展开调查。调查过程中，执法人员会制作现场检查笔录、调查询问笔录，并采集相关证据，如现场照片、监测报告等。
责令改正：若调查确认养猪场存在非法排放行为，生态环境主管部门将首先责令其停止违法行为，并限期采取治理措施消除污染。
行政处罚：根据违法情节的严重程度，生态环境主管部门将依法对养猪场作出罚款等行政处罚决定。罚款数额将依据违法行为的性质、情节及社会危害程度等因素进行裁量。
申请复议或诉讼：若养猪场对处罚决定不服，可在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼。但在此期间，处罚决定仍需执行。
三、实际案例参考
以南宁市生态环境局对横县石塘镇常琼养猪场的处罚为例，该养猪场因粪污收集管和集粪池管道断裂，导致粪水泄漏并超标排放，被生态环境主管部门处以罚款。这一案例充分说明了生态环境主管部门在处理养猪场非法排放粪污方面的职责和权力。
四、建议与措施
加强监管：生态环境主管部门应加大对养猪场的监管力度，定期开展检查，确保养猪场遵守环保法规。
完善设施：养猪场应完善粪污处理设施，确保粪污得到妥善处理，防止非法排放。
提高意识：养猪场应提高环保意识，认识到非法排放粪污对环境的危害，并主动采取措施进行整改。
法律咨询：若养猪场对环保法规或处罚决定有疑问，可及时咨询专业律师，以维护自身合法权益。
养猪场非法排放粪污将面临生态环境主管部门的严厉处罚。因此，建议养猪场严格遵守环保法规，完善粪污处理设施，提高环保意识，以避免不必要的法律风险。若遇到相关法律问题，可直接向我咨询。