在处理农村土地承包合同纠纷时，我们确实需要综合考虑多部法律法规，以确保纠纷得到公正、合理的解决。针对您提出的问题，即农村土地承包合同纠纷是适用《中华人民共和国农村土地承包法》还是《中华人民共和国民法典》合同篇的有关规定，以下是我的详细解答：
一、核心法律依据的适用
《中华人民共和国民法典》合同篇：
- 该篇详细规定了合同的订立、履行、变更、解除及违约责任等一般原则，这些原则同样适用于农村土地承包合同。例如，在签订农村土地承包合同时，双方需遵循平等、自愿、公平、诚信等基本原则，明确承包的土地面积、期限、费用等关键条款。
- 同时，合同篇中关于合同合法性的要求，如双方意思表示一致、具有民事行为能力、合同内容合法有效等，也是农村土地承包合同必须满足的基本条件。
《中华人民共和国农村土地承包法》：
- 作为专门规范农村土地承包关系的法律，该法详细规定了农村土地承包的方式、发包方和承包方的权利义务、承包期限、承包地的调整与收回等特殊规定。
- 在处理农村土地承包合同纠纷时，如果涉及这些特殊规定，如土地承包的期限、土地流转的方式和程序等，应优先适用《中华人民共和国农村土地承包法》。
二、法律适用的综合判断
- 在实际操作中，农村土地承包合同纠纷往往同时涉及《中华人民共和国民法典》合同篇的一般规定和《中华人民共和国农村土地承包法》的特殊规定。因此，在处理纠纷时，我们需要综合考虑两部法律的相关规定和要求。
- 例如，在判断农村土地承包合同的效力时，我们既要依据合同篇中关于合同合法性的要求，也要考虑《中华人民共和国农村土地承包法》中关于土地承包经营权设立和流转的特殊规定。
三、纠纷处理的具体要点
确认承包合同效力：
- 合法有效的承包合同是处理纠纷的基础。在审查合同效力时，我们既要检查合同是否满足合同篇中关于合同合法性的要求，也要确认合同是否符合《中华人民共和国农村土地承包法》的特殊规定。
处理土地流转纠纷：
- 土地流转是农村土地承包合同纠纷中的常见问题。在处理这类纠纷时，我们既要依据合同篇中关于合同变更和解除的一般规则，也要严格遵守《中华人民共和国农村土地承包法》中关于土地流转方式和程序的特殊规定。
保障土地承包经营权人的合法权益：
- 在处理纠纷时，我们应充分考虑土地承包经营权的物权属性，如排他性、支配性等。这有助于我们更准确地理解协议的法律性质、权利义务关系以及争议解决方式等关键问题，从而切实维护土地承包经营权人的合法权益。
四、结论
综上所述，农村土地承包合同纠纷在适用法律时，应综合考虑《中华人民共和国民法典》合同篇的一般规定和《中华人民共和国农村土地承包法》的特殊规定。在实际操作中，我们应根据纠纷的具体情况，灵活运用两部法律的相关规定和要求，以确保纠纷得到公正、合理的解决。