针对您提出的“保险公司以单位垫付医疗费为由拒赔怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在遭遇交通事故并垫付了医疗费用后，如果保险公司以此为由拒绝赔偿，这通常不是合理的拒赔理由。根据《中华人民共和国保险法》以及相关道路交通安全法规，保险公司有义务在保险责任范围内对伤者进行赔偿。
一、与保险公司沟通协调
了解拒赔原因：
- 您应首先与保险公司取得联系，详细了解其拒赔的具体原因。保险公司可能会提出一些如非医保用药、伤者自负责任部分等不予理赔的情况，但这些并不构成以“单位垫付医疗费”为由的拒赔。
提供必要证据：
- 在与保险公司沟通时，您需要提供相关的医疗费用发票、收据、事故责任认定书等证据，以证明您的垫付行为和伤者的实际损失。
协商解决方案：
- 您可以与保险公司协商，待保险金赔偿到位之后，双方共同前往保险公司，待伤者确认具体赔偿金额后，将您先前垫付的款项归还给您。同时，您需将先前垫付费用的收据交付给伤者或保险公司，以便保险公司直接将赔偿款支付给伤者。
二、明确保险公司的赔偿责任
非医保用药与伤者自负责任部分：
- 保险公司对于非医保用药和伤者自负责任部分可能不予理赔，但这与“单位垫付医疗费”无关。您需要了解并接受这部分不予理赔的情况。
肇事逃逸时的赔偿责任：
- 如果事故中存在肇事逃逸的情况，保险公司仍应承担赔偿责任。因为根据法律规定，保险公司有义务在强制保险金额内承担赔偿责任，同时如果肇事者还购买了商业保险，保险公司也应根据实际损失承担赔偿责任。
三、法律途径解决
如果肇事者不愿垫付医药费：
- 如果肇事者不愿垫付医药费，而您已经垫付了相关费用，您可以通过法律途径要求肇事者赔偿医药费及其他赔偿金。
向保险公司提交手续以提前支付医疗费用：
- 如果机动车均已参加保险，您可以先将相关手续及交警的处理意见提交至保险公司，以便保险公司能够提前支付医疗费用。
提起诉讼：
- 如果与保险公司无法就赔偿事宜达成共识，您可以选择向法院提起诉讼，通过法律手段维护自己的合法权益。
四、垫付医药费的回收
要求签署收据：
- 在垫付医药费时，务必要求相关方签署一份详细准确的收据，以书面形式明确确认已向其支付了相应的医疗费用。
通过医院支付：
- 您还可以选择直接将医疗费用转交给医院，并获取医院开具的预付款收据。这样在未来凭此预付款收据领取到相应的医疗费用发票时，能够便捷地完成后续的财务手续办理。
综上所述，保险公司以“单位垫付医疗费”为由拒赔是不合理的。您应与保险公司进行深入的沟通以及协调，明确其赔偿责任，并在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。