结论：三个人合伙做买卖挪用4万0900元跑路的行为，可能涉及挪用资金罪或职务侵占罪，具体取决于行为人的身份和资金性质，也可能同时涉及民事违约责任。以下是对此问题的详细分析：
一、刑事责任分析
挪用资金罪：
- 构成要件：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十二条，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的，构成挪用资金罪。
- 应用分析：若三人中的行为人系合伙企业中的工作人员，且利用职务便利挪用了合伙企业的资金4万0900元，用于个人使用或借贷给他人，且数额较大（一般5000元以上即可构成“数额较大”），则可能构成挪用资金罪。
职务侵占罪：
- 构成要件：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，构成职务侵占罪。
- 应用分析：若三人中的行为人不仅挪用了资金，而且意图将资金永久占为己有，且数额较大（一般6万元以上为“数额较大”，但各地标准可能有所不同，4万0900元在某些地区也可能达到立案标准），则可能构成职务侵占罪。若三人共同谋划并实施了侵占行为，则可能构成共同犯罪。
二、民事责任分析
- 违约责任：若三人之间存在合伙协议，且协议中明确规定了资金的使用和管理方式，那么挪用资金的行为可能构成对合伙协议的违反，从而需要承担违约责任。
- 赔偿责任：因挪用资金导致合伙企业遭受损失的，挪用者可能需要承担赔偿责任。
三、建议与措施
- 立即报警：若发现有人挪用合伙企业资金并跑路，应立即向公安机关报案，以便及时追回资金并追究犯罪者的刑事责任。
- 收集证据：在报案前或报案过程中，应尽可能收集相关证据，如资金流水、转账记录、聊天记录等，以便证明犯罪事实。
- 咨询律师：在处理此类事件时，建议咨询专业律师，以便更好地了解法律权利和义务，并制定合适的应对策略。
后续思考：在处理此类案件时，除了考虑刑事责任外，还应关注民事责任的承担。同时，对于合伙企业而言，建立健全的财务管理制度和内部控制机制至关重要，以防止类似事件的发生。若您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。